seqnames start end width strand annotation geneId transcriptId distanceToTSS Symbol Type HM data_source_link GO KEGG reference singlecell_data_source_link singlecell_dataset_reference chr1 2953961 2955972 96 * Distal Intergenic 140625 ENST00000378404.4 -65495 ACTRT2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005737,GO:0005856 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 3445853 3446738 94 * Distal Intergenic 27237 ENST00000378378.9 -7927 ARHGEF16 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0007186,GO:0030165,GO:0030971,GO:0031267,GO:0043065,GO:0045296,GO:0051056,GO:0060326,GO:0090630,GO:0090630,GO:0090630,GO:1903078 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 5232662 5233495 126 * Distal Intergenic 105376681 ENST00000443270.1 -141763 LINC02782 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 5357228 5358014 121 * Distal Intergenic 105376686 ENST00000649109.1 134790 LOC105376686 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 12736410 12736931 144 * Distal Intergenic 93190 ENST00000614859.5 -9269 C1orf158 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 14033327 14034040 94 * Intron (ENST00000636564.1/23254, intron 1 of 2) 23254 ENST00000636203.1 140535 KAZN esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001533,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005856,GO:0016607,GO:0030057,GO:0070268 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 17151848 17156722 124 * Distal Intergenic 11240 ENST00000375486.9 -32397 PADI2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004668,GO:0004668,GO:0005509,GO:0005576,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006325,GO:0010848,GO:0018101,GO:0021762,GO:0030331,GO:0030520,GO:0035327,GO:0035578,GO:0036413,GO:0036414,GO:0042803,GO:0043312,GO:0048096,GO:0070062,GO:0070100,GO:1901624,GO:1990830 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 22966400 22967184 106 * Intron (ENST00000426928.7/646262, intron 2 of 7) 646262 ENST00000426928.7 5682 LACTBL1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 22999951 23001113 177 * Distal Intergenic 729059 ENST00000622840.2 12981 TEX46 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 31456808 31460591 94 * Distal Intergenic 149086 ENST00000562339.5 -39494 LDC1P esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 31456808 31460591 94 * Distal Intergenic 149086 ENST00000562339.5 -39494 LDC1P esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 41139987 41141133 103 * Intron (ENST00000326197.11/22955, intron 5 of 14) 22955 ENST00000695337.1 18735 SCMH1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003682,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006338,GO:0007283,GO:0009952,GO:0010369,GO:0016458,GO:0042393,GO:0045892,GO:0045892 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 41338667 41339949 94 * Distal Intergenic 100132074 ENST00000372591.1 -21973 FOXO6 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006357,GO:0006357,GO:0007613,GO:0060999 hsa04068,hsa05131 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 48187520 48189454 163 * Intron (ENST00000431986.2/ENST00000431986.2, intron 1 of 4) 391037 ENST00000453388.1 -5092 SKINT1L esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 63076665 63077723 139 * Distal Intergenic 105378769 ENST00000420659.1 -64194 LINC01739 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 65743678 65745126 103 * Distal Intergenic 5142 ENST00000329654.8 -47388 PDE4B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000930,GO:0001780,GO:0004114,GO:0004115,GO:0004115,GO:0004115,GO:0004115,GO:0005634,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005891,GO:0006198,GO:0007165,GO:0007186,GO:0008021,GO:0014069,GO:0030018,GO:0030552,GO:0030593,GO:0032729,GO:0032743,GO:0035690,GO:0043015,GO:0043197,GO:0044325,GO:0044325,GO:0046872,GO:0048471,GO:0050852,GO:0050900,GO:0060076,GO:0071222,GO:0071872,GO:0086004,GO:0140199,GO:1901841,GO:1901898 hsa00230,hsa01100,hsa04024,hsa04928,hsa05032 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 66429324 66432180 114 * Distal Intergenic 5142 ENST00000483863.2 61830 PDE4B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000930,GO:0001780,GO:0004114,GO:0004115,GO:0004115,GO:0004115,GO:0004115,GO:0005634,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005891,GO:0006198,GO:0007165,GO:0007186,GO:0008021,GO:0014069,GO:0030018,GO:0030552,GO:0030593,GO:0032729,GO:0032743,GO:0035690,GO:0043015,GO:0043197,GO:0044325,GO:0044325,GO:0046872,GO:0048471,GO:0050852,GO:0050900,GO:0060076,GO:0071222,GO:0071872,GO:0086004,GO:0140199,GO:1901841,GO:1901898 hsa00230,hsa01100,hsa04024,hsa04928,hsa05032 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 69140553 69141477 171 * Intron (ENST00000658427.1/105378787, intron 2 of 3) 105378785 ENST00000660251.1 84650 LINC01707 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 73558167 73559225 94 * Distal Intergenic 109729166 ENST00000424953.1 -75991 LINC02238 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 93956154 93957027 114 * Distal Intergenic 2730 ENST00000615724.1 -46698 GCLM esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004357,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006534,GO:0006536,GO:0006750,GO:0006750,GO:0006750,GO:0006750,GO:0006750,GO:0006979,GO:0007568,GO:0007584,GO:0008637,GO:0014823,GO:0017109,GO:0017109,GO:0030234,GO:0035226,GO:0035229,GO:0035729,GO:0035733,GO:0042493,GO:0043524,GO:0044344,GO:0044752,GO:0044877,GO:0051409,GO:0051900,GO:0071333,GO:0071372,GO:0097069,GO:0097746,GO:1990830,GO:2001237 hsa00270,hsa00480,hsa01100,hsa01240,hsa04216 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 99831901 99832190 94 * Distal Intergenic 178 ENST00000361915.8 -18171 AGL esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004133,GO:0004134,GO:0004134,GO:0004135,GO:0004135,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005978,GO:0005980,GO:0005980,GO:0007584,GO:0016234,GO:0016529,GO:0030247,GO:0031593,GO:0034774,GO:0043033,GO:0043312,GO:0051384,GO:0102500,GO:1904813 hsa00500,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 101039969 101041908 125 * Intron (ENST00000451213.2/102606465, intron 1 of 4) 51611 ENST00000488789.5 -13881 DPH5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004164,GO:0004164,GO:0005575,GO:0005829,GO:0017183,GO:0017183,GO:0017183,GO:0032259 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 108357656 108358226 118 * Distal Intergenic 653149 ENST00000419814.1 -62463 NBPF6 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005737 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 116741558 116746206 112 * Distal Intergenic 914 ENST00000369478.4 -8224 CD2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001766,GO:0005102,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006915,GO:0007166,GO:0009897,GO:0009898,GO:0009986,GO:0030101,GO:0030887,GO:0030971,GO:0032729,GO:0032757,GO:0032760,GO:0032991,GO:0034113,GO:0038023,GO:0042110,GO:0042802,GO:0043621,GO:0045121,GO:0045580,GO:0046658,GO:0050900,GO:0098609 hsa04514,hsa04640 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 125085284 125087561 139 * Distal Intergenic 107985195 ENST00000450546.1 -3504760 LINC01691 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 147682021 147683489 125 * Distal Intergenic 51205 ENST00000583509.7 -11497 ACP6 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002244,GO:0003993,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005739,GO:0005759,GO:0006644,GO:0006654,GO:0016311,GO:0016791,GO:0052642,GO:0052642,GO:0052642,GO:2001311,GO:2001311 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 148310289 148311418 147 * Intron (ENST00000648583.1/ENST00000648583.1, intron 1 of 3) 105371225 ENST00000434245.3 -13018 LOC105371225 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 148310289 148311456 298 * Intron (ENST00000648583.1/ENST00000648583.1, intron 1 of 3) 105371225 ENST00000434245.3 -13018 LOC105371225 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 164094430 164094814 94 * Distal Intergenic 5087 ENST00000467023.5 -460770 PBX1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001654,GO:0001658,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005737,GO:0006357,GO:0006694,GO:0007221,GO:0007420,GO:0007548,GO:0008284,GO:0009887,GO:0009952,GO:0009954,GO:0010971,GO:0030278,GO:0030325,GO:0030326,GO:0035019,GO:0035162,GO:0045665,GO:0048536,GO:0048538,GO:0048568,GO:0048666,GO:0048706,GO:0090575,GO:1990837 hsa04927,hsa04934,hsa05202 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 166828108 166830699 166 * Distal Intergenic 57645 ENST00000449930.5 -8748 POGK esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006355,GO:0007275 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 172727952 172728453 173 * Distal Intergenic 356 ENST00000340030.4 68808 FASLG esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0005102,GO:0005123,GO:0005125,GO:0005164,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005634,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005901,GO:0006915,GO:0006919,GO:0006919,GO:0006919,GO:0006925,GO:0007165,GO:0007267,GO:0008284,GO:0008625,GO:0008625,GO:0009897,GO:0016525,GO:0019221,GO:0030644,GO:0032496,GO:0043065,GO:0043123,GO:0043123,GO:0043202,GO:0043525,GO:0045742,GO:0046666,GO:0048388,GO:0048471,GO:0060205,GO:0070062,GO:0070231,GO:0070266,GO:0070848,GO:0071346,GO:0097190,GO:0097190,GO:0097191,GO:0097527,GO:1902041,GO:1902042,GO:1903514,GO:1905782,GO:2000353 hsa01524,hsa04010,hsa04014,hsa04060,hsa04068,hsa04151,hsa04210,hsa04217,hsa04650,hsa04722,hsa04932,hsa04940,hsa05022,hsa05130,hsa05142,hsa05143,hsa05160,hsa05161,hsa05162,hsa05163,hsa05164,hsa05165,hsa05168,hsa05170,hsa05200,hsa05205,hsa05320,hsa05330,hsa05332,hsa05417 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 176156919 176158423 171 * Intron (ENST00000367667.5/64326, intron 3 of 17) 64326 ENST00000459744.5 -21837 COP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0004842,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005829,GO:0010212,GO:0016567,GO:0016607,GO:0031464,GO:0032436,GO:0043161,GO:0043687,GO:0046872,GO:0061630 hsa04115,hsa04120 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 177692323 177692871 94 * Intron (ENST00000663166.1/ENST00000663166.1, intron 1 of 4) 101928778 ENST00000427173.1 -7653 LINC01741 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 182517919 182518726 117 * Intron (ENST00000443996.6/353299, intron 10 of 21) 353299 ENST00000456971.3 10718 RGSL1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 198588884 198589125 94 * Distal Intergenic 127124 ENST00000281087.6 -47939 ATP6V1G3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0008286,GO:0016471,GO:0033572,GO:0034220,GO:0046961,GO:0051117,GO:0090383,GO:1902600 hsa00190,hsa01100,hsa04145,hsa04150,hsa04721,hsa04966,hsa05110,hsa05120,hsa05165,hsa05323 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 199494337 199495868 139 * Distal Intergenic 400800 ENST00000452199.1 345739 LINC02789 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 206120635 206122005 147 * Intron (ENST00000425896.1/ENST00000425896.1, intron 2 of 2) 553 ENST00000612906.1 -2936 AVPR1B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001992,GO:0004930,GO:0005000,GO:0005000,GO:0005080,GO:0005768,GO:0005794,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007186,GO:0007186,GO:0007202,GO:0007204,GO:0032430,GO:0042127,GO:0042277,GO:0043410,GO:0045907,GO:0060732,GO:0090238,GO:0150104 hsa04020,hsa04072,hsa04080,hsa04270 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 228240320 228244928 98 * Intron (ENST00000570156.7/84033, intron 10 of 115) 84033 ENST00000493977.2 24631 OBSCN esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005085,GO:0005515,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005546,GO:0005547,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005911,GO:0006468,GO:0007186,GO:0007275,GO:0008307,GO:0010314,GO:0016604,GO:0030016,GO:0030018,GO:0030506,GO:0031430,GO:0031432,GO:0032266,GO:0036309,GO:0042383,GO:0043065,GO:0043325,GO:0045214,GO:0046872,GO:0050790,GO:0050839,GO:0051056,GO:0070273,GO:0098609,GO:0106310,GO:0106311 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 229424019 229424620 261 * Distal Intergenic 58 ENST00000366684.7 9474 ACTA1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001725,GO:0001725,GO:0005200,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005615,GO:0005829,GO:0005865,GO:0005865,GO:0005869,GO:0005884,GO:0005884,GO:0006936,GO:0009612,GO:0009991,GO:0010226,GO:0010628,GO:0015629,GO:0017022,GO:0030017,GO:0030027,GO:0030049,GO:0030175,GO:0030240,GO:0030240,GO:0043503,GO:0043531,GO:0044297,GO:0048545,GO:0048741,GO:0070062,GO:0071417,GO:0072562,GO:0090131 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 230420142 230420698 94 * Intron (ENST00000391860.7/79605, intron 1 of 6) 79605 ENST00000391860.7 5634 PGBD5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004519,GO:0004803,GO:0004803,GO:0004803,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0090305,GO:0098038,GO:0098038 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr1 238162431 238163361 183 * Distal Intergenic 105373220 ENST00000665394.1 -75582 LOC105373220 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 7448282 7450407 150 * Intron (ENST00000670632.2/105376388, intron 4 of 4) 105376388 ENST00000660269.1 21453 LINC02642 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 7691752 7693337 94 * Distal Intergenic 3698 ENST00000358415.9 -9979 ITIH2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004866,GO:0004867,GO:0005576,GO:0005788,GO:0010951,GO:0030212,GO:0043687,GO:0044267,GO:0062023,GO:0062023,GO:0070062,GO:0072562 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 37819635 37822560 146 * Intron (ENST00000615949.6/57209, intron 6 of 6) 57209 ENST00000494133.1 15551 ZNF248 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 42148852 42151451 94 * Distal Intergenic 101929373 ENST00000622823.4 -91270 LOC101929373 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 48513901 48515009 132 * Intron (ENST00000374170.5/58504, intron 1 of 5) 100689073 ENST00000505718.1 -2312 ARHGAP22-IT1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 76055410 76056839 114 * Intron (ENST00000611255.5/83938, intron 4 of 6) 83938 ENST00000611306.1 19404 LRMDA esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0030318,GO:0030318 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 94028708 94031254 239 * Promoter (<=1kb) 51196 ENST00000689699.1 0 PLCE1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0000187,GO:0001558,GO:0004435,GO:0004435,GO:0004629,GO:0005085,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005886,GO:0006651,GO:0006651,GO:0006940,GO:0007010,GO:0007173,GO:0007173,GO:0007200,GO:0007204,GO:0007265,GO:0007507,GO:0008277,GO:0010592,GO:0016042,GO:0019722,GO:0019722,GO:0019899,GO:0030027,GO:0031267,GO:0032835,GO:0043647,GO:0045859,GO:0046578,GO:0046872,GO:0048015,GO:0048016 hsa00562,hsa01100,hsa04014,hsa04015,hsa04020,hsa04024,hsa04070,hsa04919,hsa04933,hsa05131,hsa05205 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 101172873 101175731 102 * Promoter (2-3kb) 101927396 ENST00000660354.1 -575 LINC01514 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 112863670 112864762 162 * Distal Intergenic 107984158 ENST00000428766.2 -23973 LOC107984158 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 120697697 120698870 114 * Intron (ENST00000659883.1/105378516, intron 2 of 6) 105378516 ENST00000667515.1 61701 LOC105378516 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 123128375 123129072 177 * Distal Intergenic 340784 ENST00000357878.7 -6898 HMX3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007420,GO:0007566,GO:0030154,GO:0042472,GO:0050885,GO:0060135 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 128916813 128917942 99 * Distal Intergenic 728327 ENST00000446589.1 3934 LINC02667 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 130240777 130241895 118 * Intron (ENST00000648275.1/107984002, intron 1 of 1) 107984002 ENST00000648275.1 27250 LINC02646 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 132050340 132052954 94 * Intron (ENST00000668452.1/282973, intron 1 of 23) 282973 ENST00000669493.1 -11478 JAKMIP3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005794,GO:0008017,GO:0015630,GO:0019900 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 132784237 132785203 499 * Promoter (<=1kb) 84504 ENST00000441365.2 0 NKX6-2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0010454,GO:0010455,GO:0022010,GO:0030154,GO:0031018,GO:0031641,GO:0045686,GO:0045687,GO:0045892,GO:0050885,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 133146846 133148714 148 * Distal Intergenic 85442 ENST00000478074.6 -11505 KNDC1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001934,GO:0003674,GO:0005575,GO:0007264,GO:0008150,GO:0021707,GO:0030425,GO:0032045,GO:0043025,GO:0043204,GO:0048814,GO:0050773,GO:0050790 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr10 133565282 133566717 141 * Promoter (<=1kb) 93426 ENST00000343131.7 0 SYCE1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000795,GO:0000801,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005829,GO:0007130,GO:0043231,GO:0051301 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 1133196 1135829 178 * Distal Intergenic 4586 ENST00000621226.2 -22124 MUC5AC esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002223,GO:0005201,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005737,GO:0005796,GO:0005886,GO:0016266,GO:0031012,GO:0048015,GO:0070062,GO:0070701 hsa04657 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 13545399 13547690 127 * Distal Intergenic 5741 ENST00000529816.1 -49218 PTH esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001501,GO:0005179,GO:0005179,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0005615,GO:0006874,GO:0007186,GO:0007189,GO:0007189,GO:0007202,GO:0007266,GO:0007267,GO:0008628,GO:0009967,GO:0010288,GO:0010468,GO:0010629,GO:0010960,GO:0030501,GO:0031856,GO:0031857,GO:0032331,GO:0033280,GO:0034645,GO:0042493,GO:0045453,GO:0045471,GO:0045725,GO:0045944,GO:0046058,GO:0046326,GO:0046686,GO:0047485,GO:0048018,GO:0048873,GO:0051428,GO:0051428,GO:0051926,GO:0055062,GO:0060732,GO:0071107,GO:0071774,GO:0071864,GO:0071866,GO:0090290,GO:1900158 hsa04080,hsa04928,hsa04961,hsa05323 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 20230255 20230819 187 * Distal Intergenic 120237 ENST00000524983.3 -69780 DBX1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000981,GO:0003677,GO:0005634,GO:0006357,GO:0021515,GO:0021521 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 34392854 34394570 165 * Distal Intergenic 25841 ENST00000435224.3 -34844 ABTB2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0046982,GO:0097237 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 36658863 36659753 136 * 3' UTR 107984325 ENST00000679127.1 -12166 LOC107984325 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 40988283 40988702 168 * Intron (ENST00000528697.6/57689, intron 1 of 6) 57689 ENST00000534577.1 470934 LRRC4C esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005615,GO:0016020,GO:0016021,GO:0050770,GO:0050804,GO:0050839,GO:0098632,GO:0098685,GO:0098978,GO:0099061,GO:0099560 hsa04360,hsa04514 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 43613532 43615788 134 * Intron (ENST00000526615.6/51144, intron 3 of 4) 51144 ENST00000529261.5 -28478 HSD17B12 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001968,GO:0004303,GO:0005515,GO:0005518,GO:0005789,GO:0006633,GO:0006703,GO:0008201,GO:0009923,GO:0010811,GO:0016021,GO:0030198,GO:0031012,GO:0035338,GO:0050062,GO:0102339,GO:0102340,GO:0102341,GO:0102342 hsa00062,hsa00140,hsa01040,hsa01100,hsa01212 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 50384264 50386759 112 * Distal Intergenic 646813 ENST00000532521.2 -22283 LOC646813 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 50389780 50402923 94 * Distal Intergenic 646813 ENST00000532521.2 -6119 LOC646813 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 70512089 70514139 126 * Intron (ENST00000601538.6/22941, intron 17 of 25) 22941 ENST00000654939.1 -24369 SHANK2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001750,GO:0001917,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005829,GO:0005883,GO:0005886,GO:0007416,GO:0007610,GO:0007612,GO:0008284,GO:0008328,GO:0008328,GO:0014069,GO:0014069,GO:0016324,GO:0017124,GO:0030160,GO:0030160,GO:0030426,GO:0030534,GO:0031526,GO:0035176,GO:0035255,GO:0035255,GO:0035331,GO:0043005,GO:0043025,GO:0043197,GO:0043197,GO:0045211,GO:0045211,GO:0048854,GO:0051124,GO:0051968,GO:0060170,GO:0060291,GO:0060291,GO:0060292,GO:0060997,GO:0060999,GO:0071625,GO:0097107,GO:2000311,GO:2000463 hsa04724 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 94236409 94236815 94 * Promoter (1-2kb) 105369435 ENST00000506309.6 -1335 LOC105369435 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 116654881 116655762 163 * Intron (ENST00000444123.5/101929011, intron 2 of 2) 101929011 ENST00000665087.1 15373 LINC02702 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 116665631 116666355 191 * Distal Intergenic 101929011 ENST00000665087.1 26123 LINC02702 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 128184728 128185149 107 * Distal Intergenic 105369563 ENST00000609911.1 4301 LINC02725 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr11 129773217 129774041 94 * Intron (ENST00000656097.1/ENST00000656097.1, intron 2 of 3) 120224 ENST00000281441.8 -41807 TMEM45B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 3064488 3064869 167 * Distal Intergenic 10867 ENST00000537971.5 -12486 TSPAN9 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005925,GO:0008150,GO:0097197 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 9083424 9085022 137 * Intron (ENST00000543436.2/2, intron 3 of 3) 2 ENST00000542567.1 -3026 A2M esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001869,GO:0002020,GO:0002020,GO:0002576,GO:0004866,GO:0004867,GO:0005102,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005829,GO:0007597,GO:0010951,GO:0019838,GO:0019899,GO:0019959,GO:0019966,GO:0022617,GO:0031093,GO:0043120,GO:0048306,GO:0048863,GO:0051056,GO:0062023,GO:0062023,GO:0070062,GO:0072562 hsa04610 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 14331800 14334067 94 * Distal Intergenic 55729 ENST00000539659.5 -31609 ATF7IP esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0003714,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005829,GO:0006306,GO:0016032,GO:0016604,GO:0016887,GO:0031647,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045898,GO:0050821,GO:0090309 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 41003632 41005788 104 * Promoter (1-2kb) 1272 ENST00000550305.1 0 CNTN1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0007155,GO:0007219,GO:0010628,GO:0010765,GO:0010976,GO:0016020,GO:0021549,GO:0030246,GO:0031175,GO:0045121,GO:0050731,GO:0070062,GO:0099025,GO:0099026 hsa04514 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 48471522 48472080 95 * Promoter (<=1kb) 23519 ENST00000266594.4 -479 ANP32D esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 56862235 56866196 141 * Intron (ENST00000557452.1/ENST00000557452.1, intron 1 of 1) 121214 ENST00000293502.2 68212 SDR9C7 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004745,GO:0005737 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 66100060 66100779 94 * Distal Intergenic 84298 ENST00000446587.2 29923 LLPH esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001099,GO:0001099,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005694,GO:0005730,GO:0005730,GO:0060999,GO:0097484,GO:0097484 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 75923784 75925303 112 * Intron (ENST00000552856.1/105369844, intron 1 of 4) 105369844 ENST00000552856.1 58712 LOC105369844 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 85278686 85279663 218 * Promoter (1-2kb) 8092 ENST00000316824.4 -557 ALX1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001228,GO:0001228,GO:0001755,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005794,GO:0006357,GO:0010718,GO:0016604,GO:0042803,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045893,GO:0045944,GO:0045944,GO:0048704,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 95007107 95009127 104 * Distal Intergenic 55967 ENST00000546788.1 -3359 NDUFA12 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005739,GO:0005743,GO:0005747,GO:0005747,GO:0005747,GO:0005829,GO:0006120,GO:0006979,GO:0006979,GO:0007585,GO:0008137,GO:0009055,GO:0032981,GO:0042775 hsa00190,hsa01100,hsa04714,hsa04723,hsa04932,hsa05010,hsa05012,hsa05014,hsa05016,hsa05020,hsa05022,hsa05415 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 105691626 105692688 289 * Distal Intergenic 101929110 ENST00000548557.1 -11515 CASC18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 105691626 105692688 120 * Distal Intergenic 101929110 ENST00000548557.1 -11515 CASC18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 106660255 106662844 124 * Intron (ENST00000392842.6/5992, intron 4 of 17) 5992 ENST00000551640.5 14373 RFX4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0021537,GO:0021914,GO:0045944,GO:0060271,GO:0070613,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 110996849 111000047 157 * Distal Intergenic 23316 ENST00000261726.11 -34118 CUX2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007614,GO:0010628,GO:0043565,GO:0050775,GO:0050890,GO:0051965,GO:0061003,GO:0070062,GO:0071310,GO:1990837,GO:2000463 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 119652006 119653904 109 * Intron (ENST00000537366.5/105370027, intron 1 of 3) 5564 ENST00000541640.5 -13960 PRKAB1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004672,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006468,GO:0006633,GO:0007050,GO:0007165,GO:0007165,GO:0010628,GO:0016236,GO:0016241,GO:0019901,GO:0031588,GO:0035878,GO:0050790,GO:0080090,GO:0120162,GO:1901796 hsa04068,hsa04152,hsa04211,hsa04213,hsa04371,hsa04530,hsa04710,hsa04714,hsa04910,hsa04920,hsa04921,hsa04922,hsa04931,hsa04932,hsa05410 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 120917365 120918745 121 * Distal Intergenic 105500240 ENST00000662810.1 12663 XLOC_009911 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 131430028 131431127 216 * Distal Intergenic 101929974 ENST00000618927.1 24309 LOC101929974 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 131517318 131518068 94 * Intron (ENST00000658806.1/101929974, intron 1 of 3) 101929974 ENST00000658806.1 11820 LOC101929974 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 132615862 132617670 243 * Promoter (1-2kb) 22953 ENST00000643471.2 -1106 P2RX2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001614,GO:0001666,GO:0002931,GO:0003029,GO:0004931,GO:0004931,GO:0004931,GO:0005524,GO:0005639,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007274,GO:0007528,GO:0007596,GO:0007605,GO:0009743,GO:0010524,GO:0014832,GO:0015276,GO:0016324,GO:0030432,GO:0033198,GO:0035590,GO:0042802,GO:0043025,GO:0043235,GO:0048266,GO:0048741,GO:0050850,GO:0050909,GO:0060079,GO:0098655,GO:0098794 hsa04020,hsa04080,hsa04742 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr12 133091105 133095780 94 * Intron (ENST00000356456.9/7699, intron 5 of 5) 7699 ENST00000429434.3 9520 ZNF140 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000978,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0043565,GO:0046872,GO:1990837 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 22687196 22687557 179 * Distal Intergenic 105370109 ENST00000686188.1 -196606 LOC105370109 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 28816430 28817625 301 * Promoter (2-3kb) 23281 ENST00000612955.6 -2714 MTUS2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005881,GO:0008017,GO:0008017,GO:0042803 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 36414918 36415521 149 * Distal Intergenic 8900 ENST00000630422.2 -15999 CCNA1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000079,GO:0000083,GO:0000307,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005829,GO:0007141,GO:0007283,GO:0015630,GO:0016538,GO:0016579,GO:0044772,GO:0051301,GO:0097123,GO:0097124,GO:0097124 hsa04110,hsa04152,hsa04218,hsa04914,hsa05161,hsa05165,hsa05166,hsa05169,hsa05200,hsa05202,hsa05203,hsa05221 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 48069549 48073570 158 * Intron (ENST00000495013.5/29079, intron 2 of 2) 100873965 ENST00000422483.1 -3567 MED4-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 52846641 52848106 200 * Promoter (1-2kb) 5100 ENST00000613548.1 534 PCDH8 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001756,GO:0005509,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007267,GO:0007268,GO:0016331,GO:0030425,GO:0042734,GO:0098978,GO:0099055,GO:0099179 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 64251485 64251941 135 * Distal Intergenic 144766 ENST00000650541.1 -175441 LINC00355 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 82767364 82768611 154 * Distal Intergenic 114798 ENST00000377084.3 1113782 SLITRK1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0007409,GO:0007416,GO:0030534,GO:0035264,GO:0042592,GO:0045202,GO:0050772,GO:0051965,GO:0098978,GO:0098978,GO:0098982,GO:0098982,GO:0099061,GO:0099560,GO:0099560,GO:1905606,GO:1905606 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 99971520 99973276 1483 * Promoter (<=1kb) 85416 ENST00000267294.5 0 ZIC5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007417,GO:0030154,GO:0046872,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 110932413 110934378 160 * Distal Intergenic 55608 ENST00000267339.6 -17344 ANKRD10 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr13 112415219 112419182 174 * Intron (ENST00000283550.8/122258, intron 5 of 6) 122258 ENST00000375699.3 32941 SPACA7 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001669,GO:0005576,GO:0007338,GO:0043160 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 21145095 21145960 106 * Distal Intergenic 390445 ENST00000304418.5 10103 OR5AU1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004984,GO:0005549,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911 hsa04740 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 23623980 23626040 108 * Distal Intergenic 10202 ENST00000553896.5 -4075 DHRS2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004090,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005635,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005759,GO:0008207,GO:0008285,GO:0009636,GO:0034599,GO:0043011,GO:0043066 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 23704694 23705881 157 * Intron (ENST00000664134.1/105370409, intron 2 of 5) 105370409 ENST00000669008.1 23821 LOC105370409 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 23817898 23818652 158 * Intron (ENST00000556165.3/ENST00000556165.3, intron 3 of 3) 105370409 ENST00000664659.1 -88141 LOC105370409 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 28767647 28769078 1085 * Promoter (1-2kb) 2290 ENST00000313071.7 860 FOXG1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000981,GO:0002052,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0007346,GO:0007420,GO:0007568,GO:0009953,GO:0016199,GO:0021852,GO:0042472,GO:0045665,GO:0045666,GO:0045787,GO:0045892,GO:0048664,GO:1990837,GO:1990837 hsa04068 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 28785104 28786324 754 * Promoter (<=1kb) 105370424 ENST00000664733.1 0 LINC02282 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 42305442 42308969 94 * Distal Intergenic 145581 ENST00000554171.1 606015 LRFN5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0009986,GO:0043031,GO:0050728,GO:0098978,GO:0098982,GO:0099061,GO:0099560,GO:1905606 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 44229383 44230218 94 * Intron (ENST00000654351.1/105370471, intron 1 of 3) 105370471 ENST00000553827.1 154327 LINC02307 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 45783155 45784039 94 * Distal Intergenic 105370479 ENST00000555442.1 -67203 LINC02303 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 49816943 49818090 118 * Intron (ENST00000298310.10/9147, intron 16 of 32) 9147 ENST00000555411.1 7848 NEMF esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000049,GO:0005634,GO:0043023,GO:0051168,GO:0072344,GO:1990112,GO:1990116 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 52195916 52196806 138 * Distal Intergenic 105370498 ENST00000555852.1 -66291 LINC02319 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 53418169 53418774 113 * Intron (ENST00000663444.1/105370504, intron 3 of 4) 105370504 ENST00000425648.1 48788 LOC105370504 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 55226175 55228129 138 * Distal Intergenic 9787 ENST00000554067.1 -34567 DLGAP5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005739,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007052,GO:0007059,GO:0007079,GO:0007221,GO:0007346,GO:0008017,GO:0031616,GO:0031616,GO:0034451,GO:0045842,GO:0051382,GO:0051642 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 60847586 60849211 126 * Intron (ENST00000261245.9/4331, intron 6 of 7) 4331 ENST00000553946.1 -30503 MNAT1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000079,GO:0000082,GO:0000086,GO:0000439,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005675,GO:0005675,GO:0006281,GO:0006283,GO:0006294,GO:0006357,GO:0006357,GO:0006361,GO:0006362,GO:0006363,GO:0006366,GO:0006366,GO:0006366,GO:0006367,GO:0006368,GO:0006370,GO:0007512,GO:0008270,GO:0019907,GO:0021591,GO:0043066,GO:0045737,GO:0047485,GO:0048661,GO:0051592,GO:0061575,GO:0065003,GO:0070516,GO:0070985,GO:1905775 hsa03022,hsa03420 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 68864959 68866144 139 * Distal Intergenic 87 ENST00000553882.2 12955 ACTN1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001725,GO:0001726,GO:0002576,GO:0003725,GO:0005178,GO:0005178,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005884,GO:0005886,GO:0005903,GO:0005911,GO:0005916,GO:0005925,GO:0005925,GO:0005925,GO:0007015,GO:0017166,GO:0017166,GO:0030018,GO:0030168,GO:0030220,GO:0030374,GO:0031093,GO:0031143,GO:0036344,GO:0042803,GO:0042981,GO:0042995,GO:0044325,GO:0045893,GO:0048041,GO:0051015,GO:0051017,GO:0051271,GO:0051639,GO:0070062,GO:0070527,GO:0098978,GO:0098978,GO:0099173,GO:0099186,GO:0099186 hsa04510,hsa04520,hsa04530,hsa04670,hsa04810,hsa05131,hsa05146,hsa05203,hsa05322 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 81854385 81857132 125 * Intron (ENST00000554814.1/107984704, intron 3 of 3) 107984704 ENST00000663748.1 110574 LOC107984704 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 94554263 94555442 113 * Distal Intergenic 5104 ENST00000554220.5 -6000 SERPINA5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001972,GO:0002020,GO:0002080,GO:0004867,GO:0004867,GO:0005515,GO:0005539,GO:0005576,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0006869,GO:0007283,GO:0007342,GO:0007596,GO:0008201,GO:0009897,GO:0010951,GO:0016020,GO:0031091,GO:0031094,GO:0031210,GO:0032190,GO:0032991,GO:0036024,GO:0036025,GO:0036026,GO:0036027,GO:0036028,GO:0036029,GO:0036030,GO:0051346,GO:0061107,GO:0062023,GO:0070062,GO:0070062,GO:0097181,GO:0097182,GO:0097183 hsa04610 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 95806343 95807172 199 * Distal Intergenic 100507043 ENST00000687554.1 -59415 TUNAR esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 104408568 104409762 94 * Distal Intergenic 400258 ENST00000331952.6 -170002 C14orf180 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005886,GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 104447906 104448649 187 * Distal Intergenic 400258 ENST00000331952.6 -131115 C14orf180 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005886,GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr14 104911046 104913027 119 * Distal Intergenic 122618 ENST00000649344.1 -11686 PLD4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002244,GO:0004630,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005769,GO:0005783,GO:0005789,GO:0005789,GO:0006259,GO:0006909,GO:0006909,GO:0006954,GO:0016021,GO:0032588,GO:0032588,GO:0043647,GO:0045087,GO:0045145,GO:0045335,GO:0045335,GO:0090305,GO:1900015 hsa00564,hsa00565,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 20385204 20385939 178 * Intron (ENST00000426501.5/283755, intron 14 of 15) 283755 ENST00000454045.1 54731 HERC2P3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004842,GO:0016567,GO:0046872 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 37656427 37657226 121 * Distal Intergenic 105370772 ENST00000669587.1 -165563 LOC105370772 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 39514654 39515449 114 * Intron (ENST00000558818.3/105370784, intron 1 of 3) 105370784 ENST00000559570.2 4496 LOC105370784 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 48715183 48716658 147 * Intron (ENST00000561245.1/22995, intron 3 of 3) 22995 ENST00000559165.1 13186 CEP152 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000086,GO:0000242,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005813,GO:0005813,GO:0005814,GO:0005829,GO:0007099,GO:0007099,GO:0010389,GO:0019901,GO:0051298,GO:0097711,GO:0098535,GO:0098536 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 49227852 49228447 94 * Intron (ENST00000559883.5/2585, intron 4 of 6) 2585 ENST00000561014.1 -10773 GALK2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004335,GO:0004335,GO:0005524,GO:0005829,GO:0005975,GO:0006012,GO:0033858,GO:0046835 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 67683009 67686163 208 * Intron (ENST00000178640.10/5607, intron 13 of 21) 5607 ENST00000557869.2 -17195 MAP2K5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000187,GO:0000187,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004708,GO:0004713,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005819,GO:0005829,GO:0007165,GO:0007507,GO:0018108,GO:0030307,GO:0032088,GO:0032717,GO:0034115,GO:0043154,GO:0045944,GO:0046872,GO:0050679,GO:0051247,GO:0060761,GO:0070375,GO:0071363,GO:0071499,GO:0090051,GO:2000342,GO:2001240 hsa04010,hsa04540,hsa04722,hsa04921,hsa05418 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 70002428 70003388 186 * Distal Intergenic 7090 ENST00000559608.1 48117 TLE3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003714,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005667,GO:0007165,GO:0009887,GO:0016055,GO:0045892,GO:0070491,GO:0090090,GO:0120163,GO:1904837,GO:1990907 hsa04310,hsa04330 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 70230873 70231898 94 * Distal Intergenic 7090 ENST00000558939.5 -132697 TLE3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003714,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005667,GO:0007165,GO:0009887,GO:0016055,GO:0045892,GO:0070491,GO:0090090,GO:0120163,GO:1904837,GO:1990907 hsa04310,hsa04330 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr15 74146290 74147090 192 * Distal Intergenic 57611 ENST00000565540.1 14388 ISLR2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005886,GO:0009986,GO:0009986,GO:0016021,GO:0045773,GO:0045773 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 1083172 1086549 94 * Distal Intergenic 6755 ENST00000293897.6 4346 SSTR5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004994,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007187,GO:0007218,GO:0008285,GO:0032467,GO:0038170,GO:0042277,GO:0042593,GO:0042923,GO:0043005,GO:0050796,GO:0071385 hsa04024,hsa04080,hsa04935 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 14139320 14139838 94 * Promoter (1-2kb) 57496 ENST00000573434.1 -787 MRTFB esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003713,GO:0003713,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0007517,GO:0045296,GO:0045844,GO:0045944,GO:0045944,GO:0051145 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 17598113 17599868 101 * Distal Intergenic 64131 ENST00000261381.7 -127153 XYLT1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000137,GO:0000139,GO:0000139,GO:0005615,GO:0006024,GO:0015012,GO:0015012,GO:0015012,GO:0016021,GO:0018215,GO:0030158,GO:0030158,GO:0030158,GO:0030166,GO:0030203,GO:0030206,GO:0043931,GO:0046872,GO:0048706,GO:0050650,GO:0050650 hsa00532,hsa00534,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 27873488 27875294 126 * Intron (ENST00000447459.7/146395, intron 3 of 6) 146395 ENST00000569166.1 9276 GSG1L esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005886,GO:0098685,GO:0098978,GO:0099061,GO:0099149,GO:2000311 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 46426896 46429061 182 * Distal Intergenic 124149 ENST00000571606.1 49378 ANKRD26P1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 46426896 46429061 94 * Distal Intergenic 124149 ENST00000571606.1 49378 ANKRD26P1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 58272602 58274285 96 * Intron (ENST00000219299.8/29070, intron 7 of 8) 221191 ENST00000563336.1 11017 PRSS54 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004252,GO:0005615,GO:0006508 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 68613377 68614856 167 * Distal Intergenic 1001 ENST00000429102.6 -30137 CDH3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001895,GO:0003674,GO:0005509,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005912,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007601,GO:0010628,GO:0010838,GO:0016021,GO:0016342,GO:0022405,GO:0030054,GO:0031424,GO:0032773,GO:0032912,GO:0034332,GO:0042060,GO:0042493,GO:0043568,GO:0045296,GO:0048023,GO:0051796,GO:0060901,GO:0090263,GO:0098742,GO:1902910 hsa04514 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 75120751 75122504 105 * Promoter (2-3kb) 162239 ENST00000563098.1 1193 ZFP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872,GO:1990837 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 75166774 75174716 99 * 3' UTR 162239 ENST00000567481.1 17723 ZFP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872,GO:1990837 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 87149311 87149967 144 * Intron (ENST00000562840.1/ENST00000562840.1, intron 1 of 4) 101928708 ENST00000566092.1 -62155 LOC101928708 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 88541910 88545141 133 * Distal Intergenic 100128882 ENST00000563243.1 -10857 ZFPM1-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 88997068 88999426 141 * Distal Intergenic 863 ENST00000268679.9 -19861 CBFA2T3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0001666,GO:0003714,GO:0003714,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006351,GO:0008285,GO:0030851,GO:0032436,GO:0045820,GO:0045892,GO:0045892,GO:0045892,GO:0046872,GO:1903715 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr16 89000513 89001811 143 * Distal Intergenic 863 ENST00000268679.9 -23306 CBFA2T3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0001666,GO:0003714,GO:0003714,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006351,GO:0008285,GO:0030851,GO:0032436,GO:0045820,GO:0045892,GO:0045892,GO:0045892,GO:0046872,GO:1903715 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 5086824 5098161 130 * Promoter (1-2kb) 101928000 ENST00000665679.3 0 ZNF232-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 13769645 13771132 161 * Intron (ENST00000582752.7/100874058, intron 4 of 4) 107985014 ENST00000655970.1 6526 LOC107985014 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 21841693 21844529 94 * Distal Intergenic 100134444 ENST00000567955.3 149170 KCNJ18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005242,GO:0005242,GO:0005242,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0016021,GO:0034765,GO:1990573 hsa04725,hsa04921 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 21841693 21844529 114 * Distal Intergenic 100134444 ENST00000567955.3 149170 KCNJ18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005242,GO:0005242,GO:0005242,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0016021,GO:0034765,GO:1990573 hsa04725,hsa04921 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 21841693 21844529 208 * Distal Intergenic 100134444 ENST00000567955.3 149170 KCNJ18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005242,GO:0005242,GO:0005242,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0016021,GO:0034765,GO:1990573 hsa04725,hsa04921 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 26820330 26827470 161 * Distal Intergenic 100616277 ENST00000584932.1 466526 MIR4522 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 26863397 26865406 94 * Distal Intergenic 100616277 ENST00000584932.1 428590 MIR4522 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 26865497 26873398 128 * Distal Intergenic 100616277 ENST00000584932.1 420598 MIR4522 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 26962393 26964022 230 * Distal Intergenic 100616277 ENST00000584932.1 329974 MIR4522 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 27685227 27686719 131 * Distal Intergenic 3965 ENST00000486774.1 41101 LGALS9 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002519,GO:0005534,GO:0005615,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006935,GO:0006954,GO:0007565,GO:0010628,GO:0010628,GO:0010629,GO:0010629,GO:0016936,GO:0019899,GO:0030246,GO:0030246,GO:0032496,GO:0032673,GO:0032674,GO:0032682,GO:0032689,GO:0032689,GO:0032720,GO:0032729,GO:0032731,GO:0032733,GO:0032735,GO:0032736,GO:0032753,GO:0032753,GO:0032755,GO:0032757,GO:0032760,GO:0032834,GO:0034134,GO:0034142,GO:0038066,GO:0043123,GO:0043305,GO:0045953,GO:0046007,GO:0046598,GO:0048030,GO:0051092,GO:0060135,GO:0062023,GO:0070241,GO:0070371,GO:0070374,GO:0070555,GO:0071346,GO:0071636,GO:0071639,GO:0097029,GO:0098586,GO:1900744,GO:1901224,GO:2000510,GO:2000562,GO:2000562,GO:2000563,GO:2000670,GO:2001190,GO:2001200,GO:2001269 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 45730652 45732813 181 * Promoter (1-2kb) 107985028 ENST00000578936.1 164 LOC107985028 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 48980743 48981977 94 * Distal Intergenic 2695 ENST00000357424.2 -12147 GIP esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005179,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005788,GO:0007165,GO:0007186,GO:0007565,GO:0007613,GO:0008344,GO:0009749,GO:0010269,GO:0010447,GO:0010828,GO:0014070,GO:0019233,GO:0031018,GO:0031769,GO:0032024,GO:0033993,GO:0034774,GO:0035640,GO:0042304,GO:0042493,GO:0042594,GO:0043025,GO:0043200,GO:0043434,GO:0043950,GO:0048678,GO:0050796,GO:0055123,GO:0060291,GO:0070094,GO:0070328 hsa04024,hsa04080,hsa04911 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 61698818 61702062 166 * Intron (ENST00000682755.1/83990, intron 15 of 17) 83990 ENST00000684626.1 14709 BRIP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000077,GO:0003677,GO:0003678,GO:0003678,GO:0003682,GO:0003724,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005737,GO:0006260,GO:0006289,GO:0006302,GO:0006357,GO:0007284,GO:0007286,GO:0008285,GO:0009636,GO:0010629,GO:0010705,GO:0031965,GO:0032508,GO:0046872,GO:0051026,GO:0051539,GO:0071295,GO:0071456,GO:0072520,GO:1901796,GO:1904385,GO:1990918 hsa03440,hsa03460 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr17 77009436 77009957 256 * Distal Intergenic 105371899 ENST00000564292.5 -40280 LOC105371899 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 12911496 12912256 128 * Exon (ENST00000585406.1/ENST00000585406.1, exon 1 of 1) 5771 ENST00000592059.5 17387 PTPN2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0004725,GO:0004725,GO:0004725,GO:0004726,GO:0005178,GO:0005515,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005783,GO:0005793,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0008285,GO:0008286,GO:0010804,GO:0010888,GO:0019901,GO:0019905,GO:0030183,GO:0030217,GO:0030218,GO:0030971,GO:0035335,GO:0042059,GO:0042532,GO:0042593,GO:0045650,GO:0045722,GO:0046627,GO:0050728,GO:0050860,GO:0050922,GO:0060334,GO:0060336,GO:0060339,GO:0061099,GO:0070104,GO:0070373,GO:0071345,GO:0097677,GO:1902202,GO:1902206,GO:1902215,GO:1902227,GO:1902233,GO:1902237,GO:1903899,GO:2000587 hsa04630 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 47260245 47260641 114 * Distal Intergenic 652991 ENST00000425639.3 -8585 SKOR2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005667,GO:0005737,GO:0006355,GO:0030512,GO:0030514,GO:0046332,GO:0046332,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 47260810 47261400 591 * Distal Intergenic 652991 ENST00000425639.3 -9150 SKOR2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005667,GO:0005737,GO:0006355,GO:0030512,GO:0030514,GO:0046332,GO:0046332,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 47960472 47962545 95 * Distal Intergenic 4087 ENST00000356825.8 -29326 SMAD2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000987,GO:0001228,GO:0001228,GO:0001657,GO:0001701,GO:0001706,GO:0001707,GO:0003677,GO:0003682,GO:0003690,GO:0003700,GO:0003700,GO:0005160,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005737,GO:0005829,GO:0006357,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007179,GO:0007182,GO:0007183,GO:0007352,GO:0007369,GO:0008134,GO:0008285,GO:0009653,GO:0009749,GO:0009791,GO:0009952,GO:0010718,GO:0016579,GO:0017015,GO:0019902,GO:0023019,GO:0030073,GO:0030154,GO:0030324,GO:0030325,GO:0030509,GO:0030512,GO:0030513,GO:0031016,GO:0031053,GO:0031625,GO:0032444,GO:0032924,GO:0032991,GO:0033613,GO:0034713,GO:0035019,GO:0035265,GO:0035556,GO:0038092,GO:0042060,GO:0045165,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045893,GO:0045893,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045944,GO:0046332,GO:0046872,GO:0048156,GO:0048340,GO:0048617,GO:0048701,GO:0051098,GO:0060039,GO:0060395,GO:0062009,GO:0070410,GO:0070411,GO:0070411,GO:0070412,GO:0070723,GO:0071141,GO:0071144,GO:0071144,GO:0097718,GO:1900224 hsa04110,hsa04144,hsa04218,hsa04350,hsa04371,hsa04390,hsa04550,hsa04659,hsa04926,hsa04933,hsa05142,hsa05166,hsa05200,hsa05205,hsa05210,hsa05212,hsa05225,hsa05226,hsa05321,hsa05415 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 57353932 57354684 230 * Promoter (1-2kb) 51046 ENST00000324000.4 1375 ST8SIA3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0001574,GO:0003828,GO:0003828,GO:0006486,GO:0006486,GO:0006486,GO:0006491,GO:0006491,GO:0006688,GO:0008373,GO:0009100,GO:0009311,GO:0009311,GO:0016021,GO:0033691,GO:0042802,GO:1990743 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 57427495 57429253 526 * Exon (ENST00000620778.1/ENST00000620778.1, exon 1 of 1) 9480 ENST00000491143.3 -6121 ONECUT2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001889,GO:0001952,GO:0002064,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0009887,GO:0015629,GO:0030335,GO:0030512,GO:0031018,GO:0045165,GO:0045944,GO:0048935,GO:0060271,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 63713378 63715146 94 * Intron (ENST00000489748.5/89778, intron 5 of 6) 89778 ENST00000624518.1 3184 SERPINB11 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004867,GO:0005615,GO:0005737,GO:0010951 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr18 79592352 79593177 128 * Distal Intergenic 284240 ENST00000589723.1 14289 LOC284240 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 1739874 1740781 94 * Distal Intergenic 390874 ENST00000382349.5 -12725 ONECUT3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005667,GO:0006357,GO:0045944,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 1774892 1775628 103 * Intron (ENST00000382349.5/390874, intron 1 of 1) 148229 ENST00000526847.1 15189 ATP8B3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000287,GO:0002080,GO:0005524,GO:0005789,GO:0005802,GO:0005886,GO:0007030,GO:0007339,GO:0016021,GO:0045332,GO:0140326 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 3272825 3273901 323 * Promoter (<=1kb) 60680 ENST00000588350.1 -4 CELF5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000381,GO:0000381,GO:0003723,GO:0003729,GO:0005515,GO:0005575,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006376,GO:0036002,GO:1990904 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 9497248 9502586 95 * Promoter (<=1kb) 147741 ENST00000301480.5 0 ZNF560 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000977,GO:0000981,GO:0001227,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 11771603 11773563 94 * Intron (ENST00000462251.1/126068, intron 1 of 1) 126068 ENST00000409902.5 4511 ZNF441 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000977,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 12197599 12198606 94 * Intron (ENST00000415793.8/100289333, intron 1 of 2) 100289333 ENST00000451691.2 2511 LOC100289333 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 15102988 15103332 135 * Distal Intergenic 85360 ENST00000342784.7 -4069 SYDE1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005096,GO:0005096,GO:0005096,GO:0005829,GO:0007165,GO:0016477,GO:0016477,GO:0030695,GO:0030695,GO:0031532,GO:0051056,GO:0051493,GO:0090630,GO:1901165 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 21474162 21476209 131 * Intron (ENST00000600810.1/400680, intron 2 of 4) 400680 ENST00000596718.5 -7165 LINC00664 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 22087103 22090648 128 * Intron (ENST00000651332.1/113835, intron 4 of 4) 113835 ENST00000600162.1 34567 ZNF257 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 22275972 22278494 133 * Distal Intergenic 100287226 ENST00000601693.2 -7947 ZNF729 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0001228,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 22285865 22287134 153 * Promoter (<=1kb) 100287226 ENST00000601693.2 0 ZNF729 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0001228,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 24128630 24141789 101 * 3' UTR 100101266 ENST00000598671.1 21636 HAVCR1P1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 31862052 31864454 136 * Intron (ENST00000651987.1/105372363, intron 4 of 4) 105372363 ENST00000659249.1 80906 LINC01837 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 33226996 33229550 125 * Promoter (2-3kb) 56301 ENST00000253188.8 -1146 SLC7A10 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003333,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006865,GO:0015175,GO:0015175,GO:0015179,GO:0015194,GO:0015804,GO:0015804,GO:0015825,GO:0016020,GO:0042941,GO:0042942,GO:0050900,GO:1902475 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 33897205 33899744 102 * Distal Intergenic 79047 ENST00000590385.2 90281 KCTD15 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0007275,GO:0042802,GO:0051260 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 37178656 37179987 112 * Intron (ENST00000588873.1/199704, intron 1 of 3) 199704 ENST00000356958.8 -5915 ZNF585A esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0001228,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 40022060 40038279 143 * Distal Intergenic 339327 ENST00000595225.1 17827 ZNF546 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 43834561 43845821 94 * Intron (ENST00000618787.5/284349, intron 6 of 6) 284349 ENST00000324461.9 1056 ZNF283 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 44050173 44050832 259 * Promoter (<=1kb) 7766 ENST00000588518.1 -535 ZNF223 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0008150,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 52314577 52334414 127 * Intron (ENST00000595962.6/147657, intron 4 of 4) 147657 ENST00000335090.6 -1829 ZNF480 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 52314577 52334414 128 * Intron (ENST00000595962.6/147657, intron 4 of 4) 162963 ENST00000403906.8 -1829 ZNF610 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 52649493 52650231 98 * Intron (ENST00000600714.5/55769, intron 2 of 5) 55769 ENST00000601237.5 10613 ZNF83 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 53308045 53309977 115 * Promoter (<=1kb) 107987270 ENST00000596881.1 0 LOC107987270 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 56372977 56373838 139 * Promoter (<=1kb) 147947 ENST00000482727.1 0 ZNF542P esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 56464079 56473295 105 * Promoter (1-2kb) 63934 ENST00000591790.5 0 ZNF667 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 56642727 56644426 99 * Promoter (<=1kb) 147670 ENST00000598409.6 0 SMIM17 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr19 58114672 58120690 96 * Promoter (<=1kb) 65982 ENST00000594567.1 0 ZSCAN18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0046872 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 571141 572293 176 * Intron (ENST00000444079.1/105373352, intron 4 of 4) 105373352 ENST00000654620.1 12013 LOC105373352 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 2813668 2814814 157 * Intron (ENST00000652954.1/105373390, intron 2 of 3) 105373390 ENST00000663614.1 20162 LOC105373390 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 2813668 2814814 94 * Intron (ENST00000652954.1/105373390, intron 2 of 3) 105373390 ENST00000663614.1 20162 LOC105373390 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 7577464 7578464 148 * Distal Intergenic 101929510 ENST00000664007.1 -92866 LOC101929510 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 16063106 16064369 94 * Intron (ENST00000652394.1/104797537, intron 3 of 4) 104797537 ENST00000651908.1 -5417 GACAT3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 40314321 40315146 98 * Intron (ENST00000406785.6/6546, intron 2 of 7) 100128590 ENST00000417875.1 62898 SLC8A1-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 49131431 49132567 112 * Intron (ENST00000634588.1/ENST00000634588.1, intron 2 of 4) 2492 ENST00000454032.5 21866 FSHR esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004963,GO:0004963,GO:0004963,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007186,GO:0007189,GO:0007190,GO:0007283,GO:0007292,GO:0008406,GO:0008528,GO:0008584,GO:0008584,GO:0008585,GO:0009755,GO:0010738,GO:0014068,GO:0016021,GO:0042699,GO:0042699,GO:0042699,GO:0043235,GO:0070374,GO:0071372 hsa04024,hsa04080,hsa04913 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 59418016 59419011 94 * Intron (ENST00000606382.1/ENST00000606382.1, intron 3 of 3) 105374754 ENST00000662067.1 -29638 LOC105374754 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 88290937 88291286 132 * Distal Intergenic 55258 ENST00000496165.1 108240 THNSL2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0004795,GO:0005125,GO:0005575,GO:0005615,GO:0007165,GO:0008150,GO:0009071,GO:0009071,GO:0016311,GO:0016311,GO:0030170,GO:0030170,GO:0046360,GO:0046360,GO:0070905 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 91442466 91443213 723 * Distal Intergenic 654342 ENST00000608018.5 212165 LSP1P4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 102469373 102470590 116 * Distal Intergenic 389015 ENST00000295269.5 -2636 SLC9A4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001696,GO:0002064,GO:0005774,GO:0005886,GO:0005886,GO:0006811,GO:0009651,GO:0015385,GO:0015386,GO:0016021,GO:0016323,GO:0016324,GO:0051453,GO:0055075,GO:0071805,GO:0098656,GO:0098719,GO:1902600 hsa04971 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 112944778 112945811 105 * Distal Intergenic 56300 ENST00000447128.5 -27392 IL36G esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002437,GO:0005125,GO:0005149,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005737,GO:0006954,GO:0007267,GO:0010628,GO:0019221,GO:0019221,GO:0045087,GO:0071222 hsa04060 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 121050358 121051122 114 * Distal Intergenic 29842 ENST00000464621.1 183152 TFCP2L1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000902,GO:0000978,GO:0000978,GO:0000981,GO:0001228,GO:0002070,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006357,GO:0006357,GO:0007028,GO:0007431,GO:0008340,GO:0016020,GO:0045927,GO:0045944,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 121675962 121676688 94 * Intron (ENST00000667483.1/254128, intron 3 of 4) 254128 ENST00000666647.1 25811 NIFK-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 128036139 128039190 113 * Distal Intergenic 79595 ENST00000259234.10 -8019 SAP130 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000122,GO:0016607,GO:0070822 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 129580773 129581666 145 * Distal Intergenic 105373615 ENST00000641154.1 295738 LINC02572 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 129918093 129919937 123 * Intron (ENST00000693017.1/389033, intron 1 of 3) 101927924 ENST00000450840.1 -3240 LINC01856 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 137064691 137065278 99 * Intron (ENST00000409968.6/80731, intron 3 of 27) 80731 ENST00000485379.1 -90682 THSD7B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0016021,GO:0031532 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 137846174 137846773 216 * Distal Intergenic 3176 ENST00000410115.5 -117247 HNMT esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001692,GO:0001695,GO:0002347,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006548,GO:0006972,GO:0007420,GO:0007585,GO:0014075,GO:0032259,GO:0035902,GO:0042220,GO:0043005,GO:0046539,GO:0046539,GO:0051384,GO:0070062,GO:0070555 hsa00340,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 155884821 155885641 94 * Distal Intergenic 101929378 ENST00000448255.5 138972 LINC01876 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 160824832 160826757 104 * Distal Intergenic 10010 ENST00000259075.6 -310151 TANK esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004843,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006508,GO:0006974,GO:0007165,GO:0007249,GO:0016032,GO:0018215,GO:0031625,GO:0032991,GO:0035666,GO:0035800,GO:0043124,GO:0046872,GO:0071347,GO:0071356,GO:0071479,GO:1903003,GO:2000158 hsa04140,hsa04621,hsa04622,hsa05014,hsa05022,hsa05417 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 161148258 161150147 99 * Intron (ENST00000259075.6/10010, intron 1 of 7) 105373719 ENST00000425470.1 10077 TANK-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 161278508 161278872 94 * Intron (ENST00000652531.1/101929512, intron 1 of 3) 101929512 ENST00000628042.2 -12418 LOC101929512 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 165737600 165738029 94 * Distal Intergenic 2591 ENST00000409882.5 23878 GALNT3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0004653,GO:0004653,GO:0005509,GO:0005794,GO:0005794,GO:0005794,GO:0005975,GO:0008543,GO:0016020,GO:0016021,GO:0016266,GO:0018215,GO:0018242,GO:0018243,GO:0030145,GO:0030246,GO:0032580,GO:0048471,GO:0070062 hsa00512,hsa00514,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 170916658 170918600 144 * Distal Intergenic 26003 ENST00000471559.5 -9864 GORASP2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0000139,GO:0005515,GO:0005789,GO:0005794,GO:0005794,GO:0006996,GO:0007030,GO:0007283,GO:0016020,GO:0030154,GO:0034976,GO:0061951,GO:0061951,GO:0070925 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 173296629 173301063 113 * Distal Intergenic 339751 ENST00000423106.2 -14593 MAP3K20-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 176149447 176150290 94 * Promoter (<=1kb) 406903 ENST00000385011.1 -13 MIR10B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003730,GO:0005615,GO:0010884,GO:0030949,GO:0035195,GO:0035195,GO:0035195,GO:0035278,GO:0070062,GO:0090050,GO:1903231,GO:1903589 hsa05205,hsa05206 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 196858982 196859516 94 * Intron (ENST00000354764.9/80055, intron 20 of 26) 80055 ENST00000422444.1 -12999 PGAP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005783,GO:0005783,GO:0005789,GO:0006505,GO:0006888,GO:0007605,GO:0009880,GO:0009948,GO:0015031,GO:0016021,GO:0016255,GO:0016788,GO:0021871,GO:0050185,GO:0050185,GO:1902953 hsa00563,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 202712981 202714020 106 * Intron (ENST00000392238.3/150864, intron 2 of 7) 150864 ENST00000481658.1 77492 FAM117B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 213333516 213334879 187 * Intron (ENST00000406979.6/79582, intron 7 of 17) 79582 ENST00000414961.2 37452 SPAG16 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005576,GO:0005930,GO:0007288,GO:0035082,GO:0035082,GO:0036126,GO:0060271,GO:0090660,GO:0120197,GO:1990716 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 220329120 220329865 124 * Intron (ENST00000432993.1/105373893, intron 2 of 3) 105373895 ENST00000414512.1 -120814 LOC105373895 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 230829496 230830742 144 * Distal Intergenic 51719 ENST00000493540.1 15513 CAB39 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005576,GO:0005829,GO:0007050,GO:0007165,GO:0010800,GO:0014823,GO:0016020,GO:0018105,GO:0019900,GO:0030018,GO:0030295,GO:0032147,GO:0034774,GO:0035556,GO:0035556,GO:0043312,GO:0043539,GO:0043539,GO:0070062,GO:0071476,GO:0071902,GO:0097066,GO:1901017,GO:1901380,GO:1902554,GO:1904813 hsa04150,hsa04152 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 234781684 234784340 94 * Distal Intergenic 106144537 ENST00000629370.1 99016 LINC01173 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 240096951 240097840 351 * Distal Intergenic 150678 ENST00000491765.5 36450 COPS9 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0008180,GO:0008180,GO:0008284,GO:0034644,GO:2000435 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 240271735 240273126 94 * Distal Intergenic 150677 ENST00000391989.6 -127173 OTOS esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005576,GO:0007605 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 240487611 240490768 123 * Intron (ENST00000373318.6/51281, intron 11 of 13) 51281 ENST00000407275.2 9336 ANKMY1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0046872 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 240823429 240824069 94 * Promoter (<=1kb) 547 ENST00000675152.1 224 KIF1A esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003774,GO:0003777,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005829,GO:0005871,GO:0005874,GO:0007018,GO:0008017,GO:0008021,GO:0008089,GO:0008574,GO:0016192,GO:0016887,GO:0022027,GO:0030424,GO:0030425,GO:0030705,GO:0042802,GO:0043025,GO:0060998,GO:0061001,GO:0098674,GO:0098794,GO:0098840,GO:0098992,GO:0099519,GO:1904115,GO:1990048,GO:1990049 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr2 241826241 241827840 94 * Distal Intergenic 129807 ENST00000428592.1 12224 NEU4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004308,GO:0004308,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005741,GO:0005743,GO:0005764,GO:0005764,GO:0005789,GO:0005886,GO:0006516,GO:0006687,GO:0006689,GO:0006689,GO:0009313,GO:0009313,GO:0010977,GO:0016020,GO:0019866,GO:0043005,GO:0043202,GO:0043231,GO:0052794,GO:0052795,GO:0052796 hsa00511,hsa00600,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 2811675 2812736 156 * Promoter (2-3kb) 100288797 ENST00000380593.4 -2232 TMEM239 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 12138356 12138732 180 * Distal Intergenic 107985406 ENST00000654812.1 179489 LOC107985406 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 20244319 20244856 94 * Intron (ENST00000245957.10/26074, intron 18 of 26) 26074 ENST00000389656.4 16073 CFAP61 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001536,GO:0003341,GO:0005930,GO:0031514,GO:0044782 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 23220699 23222007 105 * Distal Intergenic 100505664 ENST00000662902.1 31387 LOC100505664 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 33168340 33169652 94 * Promoter (1-2kb) 140683 ENST00000354932.6 181 BPIFA2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001530,GO:0001530,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005576,GO:0005615,GO:0019730,GO:0030141,GO:0042742,GO:0070062 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 44811316 44812966 134 * Promoter (<=1kb) 140730 ENST00000372851.8 -770 RIMS4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0006836,GO:0006887,GO:0042391,GO:0044325,GO:0048786,GO:0097060,GO:2000300 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 44811316 44812966 94 * Promoter (1-2kb) 140730 ENST00000372851.8 -770 RIMS4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0006836,GO:0006887,GO:0042391,GO:0044325,GO:0048786,GO:0097060,GO:2000300 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 44811316 44812966 210 * Promoter (1-2kb) 140730 ENST00000372851.8 -770 RIMS4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0006836,GO:0006887,GO:0042391,GO:0044325,GO:0048786,GO:0097060,GO:2000300 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 52505552 52506512 105 * Intron (ENST00000663974.1/105372666, intron 3 of 4) 101927700 ENST00000665561.1 -112790 LINC01524 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 58119322 58120046 147 * Distal Intergenic 128602 ENST00000371168.4 -30856 C20orf85 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr20 63012652 63014271 262 * Intron (ENST00000606208.5/63930, intron 1 of 1) 63930 ENST00000607802.1 3269 LINC01749 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 9008258 9009632 128 * Intron (ENST00000623236.1/ENST00000623236.1, intron 1 of 1) 103504731 ENST00000581792.1 21259 MIR3648-2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 9769765 9771001 112 * Distal Intergenic 441058 ENST00000623933.1 38722 LINC01667 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 10425270 10426309 158 * Intron (ENST00000474011.5/85319, intron 2 of 2) 85319 ENST00000470054.5 11738 BAGE2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 10427272 10428597 96 * Intron (ENST00000474011.5/85319, intron 2 of 2) 85319 ENST00000470054.5 13740 BAGE2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 10615124 10617477 186 * Distal Intergenic 7179 ENST00000618007.5 93541 TPTE esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004725,GO:0005634,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006470,GO:0007165,GO:0008138,GO:0008285,GO:0014065,GO:0016021,GO:0016311,GO:0016314,GO:0035335,GO:0042995,GO:0046856,GO:0048870,GO:0051896 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 10622280 10622868 103 * Distal Intergenic 7179 ENST00000618007.5 100697 TPTE esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004725,GO:0005634,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006470,GO:0007165,GO:0008138,GO:0008285,GO:0014065,GO:0016021,GO:0016311,GO:0016314,GO:0035335,GO:0042995,GO:0046856,GO:0048870,GO:0051896 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 18868971 18870087 94 * Distal Intergenic 101927797 ENST00000653218.1 -108651 MIR548XHG esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 21344599 21346243 94 * Intron (ENST00000400546.6/4685, intron 8 of 17) 4685 ENST00000461281.1 54522 NCAM2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007158,GO:0007413,GO:0007608,GO:0016021,GO:0016604,GO:0030424,GO:0042802,GO:0043005 hsa04514,hsa05020 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 33069075 33069704 322 * Promoter (<=1kb) 116448 ENST00000382348.2 -437 OLIG1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0014003,GO:0030182,GO:0046983,GO:0048663 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 34659711 34662741 159 * Distal Intergenic 54102 ENST00000349499.3 -6253 CLIC6 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005244,GO:0005254,GO:0005737,GO:0005886,GO:0031749,GO:0031750,GO:0031751,GO:0034707,GO:0034765,GO:0070062,GO:1902476 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 37348152 37349199 321 * Intron (ENST00000663813.1/ENST00000663813.1, intron 1 of 1) 1859 ENST00000646523.1 -16374 DYRK1A esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000381,GO:0003713,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004674,GO:0004674,GO:0004674,GO:0004712,GO:0004713,GO:0004715,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005856,GO:0006468,GO:0006468,GO:0007399,GO:0007623,GO:0016032,GO:0016607,GO:0016607,GO:0018105,GO:0018105,GO:0018105,GO:0018107,GO:0018107,GO:0018108,GO:0018108,GO:0030424,GO:0030425,GO:0031115,GO:0033120,GO:0034205,GO:0036289,GO:0038083,GO:0038083,GO:0042802,GO:0043518,GO:0043621,GO:0045893,GO:0046777,GO:0048025,GO:0048156,GO:0048156,GO:0050321,GO:0090312,GO:1990904 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 44491660 44494232 94 * Exon (ENST00000698336.1/111216286, exon 2 of 2) 111216286 ENST00000698336.1 6089 LINC02575 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 44706109 44706783 675 * Intron (ENST00000323084.9/54084, intron 1 of 11) 54084 ENST00000642437.1 4764 TSPEAR esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005576,GO:0007165,GO:0007219,GO:0007605,GO:0008593,GO:0009986,GO:0022405,GO:0032420,GO:0034505,GO:0060170 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr21 46062901 46063468 114 * Distal Intergenic 105372842 ENST00000451618.1 25849 LOC105372842 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr22 11592189 11595337 192 * Distal Intergenic 107984037 ENST00000657566.1 -232186 LOC107984037 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr22 47638381 47639011 163 * Intron (ENST00000650947.2/284930, intron 2 of 6) 284930 ENST00000652675.1 3200 LOC284930 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr22 48776198 48777587 147 * Intron (ENST00000336769.9/25817, intron 3 of 3) 100616415 ENST00000580946.1 -2708 MIR4535 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr22 49327515 49328688 102 * Distal Intergenic 348645 ENST00000498829.1 96749 MIR3667HG esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr22 49701668 49702610 108 * Distal Intergenic 348645 ENST00000400023.5 -44126 MIR3667HG esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr22 49744294 49745439 119 * Distal Intergenic 23774 ENST00000479985.1 30676 BRD1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005694,GO:0016607,GO:0030425,GO:0035902,GO:0036409,GO:0042393,GO:0042393,GO:0043204,GO:0043249,GO:0043966,GO:0043972,GO:0043994,GO:0044154,GO:0044154,GO:0045648,GO:0046872,GO:0051602,GO:0070776,GO:0070776 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 3489925 3490601 148 * Intron (ENST00000420000.6/ENST00000420000.6, intron 2 of 4) 57633 ENST00000319331.4 -308830 LRRN1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005615,GO:0016021,GO:0031012,GO:0051965 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 10905797 10908765 132 * Intron (ENST00000254488.7/6538, intron 6 of 13) 6538 ENST00000464828.1 -25201 SLC6A11 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005332,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007420,GO:0008028,GO:0015718,GO:0015812,GO:0016021,GO:0035725,GO:0042493,GO:0043005,GO:0098810,GO:0098982,GO:0099055,GO:0099056 hsa04721,hsa04727 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 13283390 13284838 218 * Promoter (<=1kb) 9922 ENST00000648114.1 -109 IQSEC1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005085,GO:0005515,GO:0005730,GO:0008021,GO:0008289,GO:0014069,GO:0016020,GO:0030036,GO:0032012,GO:0043231,GO:0043547,GO:0051549,GO:0060996,GO:0120183 hsa04144 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 13283390 13284838 298 * Promoter (<=1kb) 9922 ENST00000648114.1 -109 IQSEC1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005085,GO:0005515,GO:0005730,GO:0008021,GO:0008289,GO:0014069,GO:0016020,GO:0030036,GO:0032012,GO:0043231,GO:0043547,GO:0051549,GO:0060996,GO:0120183 hsa04144 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 14221048 14222352 112 * Distal Intergenic 27258 ENST00000306024.4 42231 LSM3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000398,GO:0000398,GO:0000398,GO:0000398,GO:0000932,GO:0003723,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005688,GO:0005829,GO:0006397,GO:0030629,GO:0033962,GO:0043928,GO:0046540,GO:0046540,GO:0071005,GO:0071011,GO:0071013,GO:0071013,GO:0120115,GO:1990726 hsa03018,hsa03040 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 28003026 28004140 94 * Intron (ENST00000643609.1/ENST00000643609.1, intron 1 of 6) 107986041 ENST00000356047.4 55128 LINC01967 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 41124539 41125710 94 * Distal Intergenic 1499 ENST00000643541.1 -69031 CTNNB1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000209,GO:0000791,GO:0000922,GO:0001085,GO:0001085,GO:0001102,GO:0001569,GO:0001837,GO:0002052,GO:0003682,GO:0003713,GO:0003713,GO:0003713,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005737,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005911,GO:0005912,GO:0005912,GO:0005925,GO:0005938,GO:0007155,GO:0007223,GO:0008013,GO:0008022,GO:0008134,GO:0008134,GO:0008285,GO:0010718,GO:0010909,GO:0016020,GO:0016032,GO:0016055,GO:0016323,GO:0016328,GO:0016342,GO:0016342,GO:0016525,GO:0019827,GO:0019899,GO:0019900,GO:0019903,GO:0019903,GO:0030054,GO:0030054,GO:0030331,GO:0030877,GO:0030997,GO:0032355,GO:0032481,GO:0032991,GO:0032993,GO:0033234,GO:0034333,GO:0034394,GO:0035257,GO:0035257,GO:0035257,GO:0035315,GO:0035635,GO:0035995,GO:0036023,GO:0042493,GO:0042995,GO:0043065,GO:0043066,GO:0043161,GO:0043525,GO:0044325,GO:0044334,GO:0044336,GO:0045202,GO:0045294,GO:0045294,GO:0045296,GO:0045296,GO:0045296,GO:0045765,GO:0045892,GO:0045893,GO:0045893,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045944,GO:0045976,GO:0046332,GO:0048145,GO:0048471,GO:0048660,GO:0050767,GO:0051091,GO:0051149,GO:0051571,GO:0060070,GO:0060070,GO:0060828,GO:0061154,GO:0061324,GO:0061549,GO:0070062,GO:0070369,GO:0070411,GO:0070602,GO:0071363,GO:0071681,GO:0071944,GO:0072182,GO:0090279,GO:0098609,GO:1904798,GO:1904837,GO:1904886,GO:1904948,GO:1904954,GO:1990138,GO:1990907,GO:1990907,GO:1990909,GO:2000008,GO:2000144 hsa04015,hsa04310,hsa04390,hsa04510,hsa04520,hsa04550,hsa04670,hsa04916,hsa04919,hsa04934,hsa05010,hsa05022,hsa05100,hsa05132,hsa05160,hsa05163,hsa05165,hsa05167,hsa05200,hsa05205,hsa05210,hsa05213,hsa05215,hsa05216,hsa05217,hsa05224,hsa05225,hsa05226,hsa05412,hsa05418 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 43323196 43323713 110 * Intron (ENST00000454177.5/54861, intron 4 of 7) 54861 ENST00000484791.1 -8453 SNRK esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000287,GO:0004674,GO:0004674,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006468,GO:0006468,GO:0030099,GO:0035556,GO:0106310,GO:0106311 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 46839666 46842056 94 * Intron (ENST00000653454.1/4634, intron 6 of 6) 339906 ENST00000661693.1 -5571 PRSS42P esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004252,GO:0005615,GO:0005737,GO:0005886,GO:0006508,GO:0007283,GO:0030154,GO:0031225 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 65646677 65648486 151 * Intron (ENST00000330909.12/9223, intron 1 of 24) 9223 ENST00000621418.4 -24587 MAGI1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005911,GO:0005911,GO:0005912,GO:0005923,GO:0007155,GO:0007165,GO:0007166,GO:0008022,GO:0022409,GO:0030054,GO:0042995,GO:0051393,GO:0060090,GO:0065003,GO:0071944 hsa04015,hsa04151,hsa04530,hsa05165 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 75658290 75659171 350 * Exon (ENST00000474487.1/ENST00000474487.1, exon 1 of 1) 100288801 ENST00000308062.8 -5157 FRG2C esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005634 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 75664155 75665284 94 * Promoter (<=1kb) 100288801 ENST00000464571.1 0 FRG2C esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005634 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 78240250 78241610 94 * Distal Intergenic 105377172 ENST00000465795.1 -193456 LINC02077 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 84707286 84707936 141 * Intron (ENST00000484892.5/440970, intron 11 of 20) 440970 ENST00000653196.1 -11661 LINC00971 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 86040210 86040647 133 * Intron (ENST00000383699.8/253559, intron 8 of 9) 100874037 ENST00000467225.1 -212160 CADM2-AS2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 106602544 106604401 141 * Distal Intergenic 101929485 ENST00000668075.1 -45153 LOC101929485 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 108446197 108448071 94 * Intron (ENST00000693548.1/22989, intron 21 of 40) 22989 ENST00000478998.5 11362 MYH15 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002074,GO:0003774,GO:0005516,GO:0005524,GO:0005829,GO:0016459,GO:0030016,GO:0032982,GO:0043231,GO:0051015 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 112146693 112147856 136 * Intron (ENST00000305815.10/285335, intron 28 of 28) 112806053 ENST00000563632.1 13270 TBILA esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 119286778 119288421 119 * Intron (ENST00000470790.1/100874201, intron 3 of 3) 57514 ENST00000264245.9 -5962 ARHGAP31 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005096,GO:0005829,GO:0005925,GO:0007264,GO:0017124,GO:0030027,GO:0043547,GO:0051056 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 126233492 126234394 177 * Intron (ENST00000670210.1/ENST00000670210.1, intron 2 of 5) 100862662 ENST00000500525.1 26237 ALDH1L1-AS2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 127056284 127058565 184 * Distal Intergenic 5361 ENST00000505278.1 24429 PLXNA1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002116,GO:0002116,GO:0005654,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007162,GO:0007275,GO:0008360,GO:0014910,GO:0017154,GO:0017154,GO:0030334,GO:0038023,GO:0043087,GO:0050772,GO:0060666,GO:0070062,GO:1902287,GO:1990138 hsa04360 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 127499561 127501417 94 * Promoter (1-2kb) 101927149 ENST00000634757.1 0 LINC01471 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 129946968 129947665 94 * Distal Intergenic 7200 ENST00000507066.1 -27023 TRH esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001666,GO:0001692,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005634,GO:0005886,GO:0007165,GO:0007186,GO:0007267,GO:0008437,GO:0009409,GO:0009749,GO:0009755,GO:0014050,GO:0014054,GO:0030141,GO:0032024,GO:0042755,GO:0045471,GO:0051412,GO:2000252 hsa04080 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 134389889 134390309 138 * Distal Intergenic 51421 ENST00000514516.5 -14410 AMOTL2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001525,GO:0003365,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005923,GO:0016055,GO:0030036,GO:0030334,GO:0031410,GO:0035329,GO:0035329,GO:0055037 hsa04530 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 136319392 136322181 100 * Intron (ENST00000251654.9/5096, intron 10 of 14) 10274 ENST00000465961.1 37008 STAG1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000775,GO:0000785,GO:0000785,GO:0003682,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005694,GO:0005829,GO:0007062,GO:0008278,GO:0008278,GO:0016363,GO:0016604,GO:0051301,GO:0090307,GO:0097431 hsa04110 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 137180125 137180823 132 * Distal Intergenic 107986136 ENST00000462176.2 -197929 IL20RB-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 138433905 138434290 343 * Promoter (<=1kb) 83850 ENST00000486831.5 -296 ESYT3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005515,GO:0005544,GO:0005789,GO:0005887,GO:0006687,GO:0006869,GO:0008429,GO:0031210,GO:0031227,GO:0031227,GO:0031234,GO:0031234,GO:0035091,GO:0044232,GO:0061817,GO:0140268 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 147407720 147408915 285 * Promoter (1-2kb) 84107 ENST00000464144.1 -450 ZIC4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0003677,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007417,GO:0046872,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 147409228 147411420 2193 * Promoter (<=1kb) 7545 ENST00000282928.5 0 ZIC1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0003700,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0006357,GO:0007389,GO:0007417,GO:0007420,GO:0008589,GO:0030154,GO:0042307,GO:0042472,GO:0045893,GO:0046872,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 147411669 147413495 169 * Promoter (2-3kb) 7545 ENST00000282928.5 2304 ZIC1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0003700,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0006357,GO:0007389,GO:0007417,GO:0007420,GO:0008589,GO:0030154,GO:0042307,GO:0042472,GO:0045893,GO:0046872,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 193756406 193757465 234 * Distal Intergenic 105374282 ENST00000666648.1 14959 LOC105374282 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 194051041 194052357 114 * Promoter (1-2kb) 285389 ENST00000661206.1 88 LINC02028 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr3 194318110 194319340 171 * Intron (ENST00000670716.1/100131551, intron 1 of 3) 100131551 ENST00000670716.1 3501 LINC00887 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 3877790 3878224 94 * Distal Intergenic 348926 ENST00000506770.5 74941 FAM86EP esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 4857641 4858659 745 * Promoter (1-2kb) 4487 ENST00000382723.5 -1006 MSX1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000902,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000987,GO:0001227,GO:0001228,GO:0001701,GO:0002039,GO:0003198,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0007517,GO:0008285,GO:0009952,GO:0010463,GO:0021983,GO:0023019,GO:0030308,GO:0030513,GO:0030901,GO:0034504,GO:0035115,GO:0035116,GO:0035880,GO:0042474,GO:0042475,GO:0042481,GO:0043066,GO:0043517,GO:0045944,GO:0048598,GO:0048863,GO:0050821,GO:0051154,GO:0060021,GO:0060325,GO:0060349,GO:0060536,GO:0061180,GO:0061312,GO:0071316,GO:0090427,GO:1902255,GO:1990837,GO:2000678,GO:2001055 hsa05166 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 6243801 6246102 345 * Promoter (<=1kb) 7466 ENST00000673884.1 0 WFS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0001822,GO:0003091,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005788,GO:0005789,GO:0005789,GO:0006983,GO:0006983,GO:0007601,GO:0007605,GO:0022417,GO:0030176,GO:0030176,GO:0030425,GO:0030433,GO:0030433,GO:0030968,GO:0031398,GO:0031398,GO:0031625,GO:0032469,GO:0034976,GO:0036498,GO:0042593,GO:0043069,GO:0043433,GO:0043524,GO:0043687,GO:0044267,GO:0045927,GO:0050821,GO:0050821,GO:0050821,GO:0050877,GO:0051117,GO:0051247,GO:0051928,GO:0055074,GO:0055074,GO:1903892,GO:2000675 hsa04141 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 6243801 6246102 174 * Promoter (<=1kb) 7466 ENST00000673884.1 0 WFS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0001822,GO:0003091,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005788,GO:0005789,GO:0005789,GO:0006983,GO:0006983,GO:0007601,GO:0007605,GO:0022417,GO:0030176,GO:0030176,GO:0030425,GO:0030433,GO:0030433,GO:0030968,GO:0031398,GO:0031398,GO:0031625,GO:0032469,GO:0034976,GO:0036498,GO:0042593,GO:0043069,GO:0043433,GO:0043524,GO:0043687,GO:0044267,GO:0045927,GO:0050821,GO:0050821,GO:0050821,GO:0050877,GO:0051117,GO:0051247,GO:0051928,GO:0055074,GO:0055074,GO:1903892,GO:2000675 hsa04141 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 6333888 6334491 138 * Intron (ENST00000335585.9/5522, intron 6 of 8) 107986257 ENST00000650929.1 -25252 LOC107986257 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 7552033 7554596 94 * Intron (ENST00000507866.6/57537, intron 3 of 26) 100422826 ENST00000579577.1 92005 MIR4274 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 13523429 13525417 1046 * Distal Intergenic 285547 ENST00000628853.1 5955 LINC01097 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 14691712 14692257 117 * Intron (ENST00000505089.6/201853, intron 3 of 6) 201853 ENST00000506292.2 24338 LINC00504 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 16473254 16474931 95 * Intron (ENST00000512370.5/105374505, intron 2 of 2) 9079 ENST00000509803.1 32296 LDB2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0001102,GO:0001942,GO:0003712,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005667,GO:0005730,GO:0005886,GO:0007399,GO:0010669,GO:0019899,GO:0030274,GO:0030274,GO:0030334,GO:0031252,GO:0035019,GO:0043549,GO:0044089,GO:0045944 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 25221753 25226912 115 * Intron (ENST00000512921.4/55300, intron 1 of 9) 55300 ENST00000264864.8 -7121 PI4K2B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004430,GO:0005524,GO:0005768,GO:0005802,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006661,GO:0007030,GO:0007032,GO:0016020,GO:0046854 hsa00562,hsa01100,hsa04070 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 26773887 26775014 210 * Distal Intergenic 57620 ENST00000477474.3 -82587 STIM2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002115,GO:0005246,GO:0005246,GO:0005509,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005783,GO:0005789,GO:0005886,GO:0005886,GO:0006874,GO:0006874,GO:0015279,GO:0016021,GO:0032237,GO:0032237,GO:0032237,GO:0051928,GO:0051928,GO:0070588 hsa04020 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 49097734 49100788 194 * Distal Intergenic 80157 ENST00000507372.1 69042 CWH43 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005783,GO:0006506,GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 74046875 74047698 119 * Distal Intergenic 10895 ENST00000513150.1 7701 PPBPP2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 76325405 76326996 206 * Exon (ENST00000504667.2/339965, exon 11 of 13) 105377286 ENST00000670253.1 -13307 LOC105377286 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 106010816 106011553 102 * Intron (ENST00000513220.1/101929577, intron 3 of 3) 101929577 ENST00000513220.1 10925 LOC101929577 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 110618835 110620072 1074 * Promoter (<=1kb) 5308 ENST00000556049.1 644 PITX2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000976,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001102,GO:0003253,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005667,GO:0006357,GO:0006357,GO:0007368,GO:0008134,GO:0009653,GO:0035315,GO:0035993,GO:0042476,GO:0043010,GO:0045944,GO:0045944,GO:0048536,GO:0060126,GO:0060127,GO:0060971,GO:0061072,GO:0061325,GO:0070986,GO:1990837 hsa04350 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 140571418 140572202 126 * Promoter (2-3kb) 7350 ENST00000262999.4 -2457 UCP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002024,GO:0005739,GO:0005743,GO:0005743,GO:0006357,GO:0009266,GO:0009409,GO:0016021,GO:0017077,GO:0017077,GO:0022857,GO:0031667,GO:0032555,GO:0032870,GO:0034614,GO:0036041,GO:0050873,GO:0070417,GO:0071398,GO:0120162,GO:1901612,GO:1902600,GO:1902600,GO:1903426,GO:1990542,GO:1990542,GO:1990845,GO:1990845 hsa03320,hsa04371,hsa04714,hsa05016 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 145093704 145094896 114 * Intron (ENST00000649263.1/10393, intron 2 of 8) 10393 ENST00000504721.5 2486 ANAPC10 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005654,GO:0005680,GO:0005680,GO:0005829,GO:0006511,GO:0007049,GO:0031145,GO:0051301,GO:0070979,GO:0070979,GO:1901990 hsa04110,hsa04114,hsa04120,hsa04914,hsa05166 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 154195096 154195864 115 * Intron (ENST00000660197.1/101927947, intron 3 of 4) 101927947 ENST00000623325.1 -5956 LOC101927947 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 156932820 156933842 94 * Intron (ENST00000502773.6/56034, intron 1 of 5) 56034 ENST00000422544.2 37061 PDGFC esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0005161,GO:0005161,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005615,GO:0005634,GO:0005788,GO:0005829,GO:0005886,GO:0007171,GO:0007417,GO:0008083,GO:0008284,GO:0008284,GO:0009887,GO:0009986,GO:0014068,GO:0030335,GO:0031954,GO:0042803,GO:0043406,GO:0048008,GO:0048008,GO:0048146,GO:0048565,GO:0048568,GO:0050730,GO:0051781,GO:0060348,GO:0070062,GO:0070374,GO:0070851,GO:0071230,GO:0120162 hsa01521,hsa04010,hsa04014,hsa04015,hsa04020,hsa04072,hsa04151,hsa04510,hsa04540,hsa04810,hsa05215,hsa05218,hsa05231 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 160361955 160362842 131 * Distal Intergenic 105377512 ENST00000512652.1 -176412 LINC02477 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 161428118 161429474 139 * Intron (ENST00000306100.10/56884, intron 15 of 15) 56884 ENST00000511999.1 70600 FSTL5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005515,GO:0005576,GO:0007275,GO:0030154 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 169805441 169806128 176 * Distal Intergenic 54969 ENST00000393381.3 -47497 HPF1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0006974,GO:0006974,GO:0008270,GO:0010835,GO:0010835,GO:0018312,GO:0018312,GO:0018312,GO:0042393,GO:0042393,GO:0072572 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 172895309 172897439 106 * Intron (ENST00000506823.6/442117, intron 8 of 12) 442117 ENST00000616459.1 85949 GALNTL6 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0004653,GO:0005794,GO:0016021,GO:0018215,GO:0018243,GO:0030246,GO:0046872 hsa00512,hsa00514,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 173509140 173509591 337 * Promoter (<=1kb) 101928409 ENST00000684811.1 631 LOC101928409 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 182118135 182118986 135 * Intron (ENST00000509012.5/90768, intron 1 of 4) 90768 ENST00000505873.1 24790 TENM3-AS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr4 189810967 189811854 94 * Intron (ENST00000660244.1/728339, intron 3 of 3) 105377617 ENST00000503609.1 -69661 LINC01596 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 566507 567388 233 * Distal Intergenic 100616381 ENST00000582112.1 -30625 MIR4456 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 566567 567388 151 * Distal Intergenic 100616381 ENST00000582112.1 -30685 MIR4456 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 1156361 1157959 179 * Distal Intergenic 101928857 ENST00000505972.2 20587 CTD-3080P12.3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 2691672 2692060 143 * Distal Intergenic 101234261 ENST00000626215.1 -20531 LSINCT5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 16009305 16010526 182 * Distal Intergenic 100126347 ENST00000401258.3 74123 MIR887 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0035195 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 29784829 29785266 107 * Distal Intergenic 101929681 ENST00000659199.1 -388734 LINC02064 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 32187374 32188352 137 * Distal Intergenic 64083 ENST00000265070.7 -13055 GOLPH3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005739,GO:0005758,GO:0005768,GO:0005794,GO:0005794,GO:0005802,GO:0005802,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006890,GO:0007030,GO:0007030,GO:0009101,GO:0009306,GO:0010467,GO:0010821,GO:0016477,GO:0019899,GO:0030032,GO:0031985,GO:0031985,GO:0032008,GO:0032580,GO:0043001,GO:0043001,GO:0043066,GO:0043231,GO:0045053,GO:0048194,GO:0048194,GO:0050714,GO:0050901,GO:0060352,GO:0070273,GO:0070273,GO:0072752,GO:0090161,GO:0090164 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 39089579 39090475 119 * Distal Intergenic 253260 ENST00000513566.1 -15180 RICTOR esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001938,GO:0005515,GO:0005829,GO:0009792,GO:0010468,GO:0016032,GO:0018105,GO:0019901,GO:0030838,GO:0031532,GO:0031932,GO:0031932,GO:0032008,GO:0032148,GO:0032956,GO:0033135,GO:0038203,GO:0043022,GO:0043087,GO:0043539,GO:0050727,GO:0050731,GO:0051896,GO:0051897,GO:0071902,GO:2000114 hsa04150 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 40248905 40249958 94 * Intron (ENST00000637924.2/106144578, intron 2 of 2) 106144578 ENST00000637924.2 8738 LINC00604 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 42993563 42994226 523 * Promoter (<=1kb) 643977 ENST00000659142.2 -223 FLJ32255 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 43334002 43336951 94 * Distal Intergenic 3157 ENST00000433297.2 -20490 HMGCS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001889,GO:0004421,GO:0004421,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006084,GO:0006629,GO:0006695,GO:0007420,GO:0008144,GO:0008584,GO:0009645,GO:0010142,GO:0014074,GO:0016853,GO:0019216,GO:0033197,GO:0042493,GO:0042803,GO:0043177,GO:0045540,GO:0046690,GO:0071372,GO:0071397,GO:0071404 hsa00072,hsa00280,hsa00650,hsa00900,hsa01100,hsa03320 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 53693884 53698060 107 * Distal Intergenic 4724 ENST00000509443.1 47689 NDUFS4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001932,GO:0005515,GO:0005739,GO:0005743,GO:0005747,GO:0005747,GO:0005747,GO:0006120,GO:0006120,GO:0007420,GO:0008137,GO:0008137,GO:0019933,GO:0032981,GO:0032981,GO:0045333,GO:0048146,GO:0051591,GO:0072593 hsa00190,hsa01100,hsa04714,hsa04723,hsa04932,hsa05010,hsa05012,hsa05014,hsa05016,hsa05020,hsa05022,hsa05415 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 56396815 56397434 114 * Distal Intergenic 102467147 ENST00000653172.1 67662 LINC01948 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 73382206 73382655 171 * Promoter (<=1kb) 107986383 ENST00000505955.1 0 LOC107986383 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 75217199 75218340 108 * Intron (ENST00000274361.3/256006, intron 3 of 24) 256006 ENST00000274361.3 18538 ANKRD31 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0005634,GO:0007129,GO:0010780,GO:1903343 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 97213298 97214069 159 * Intron (ENST00000504578.2/101926893, intron 5 of 6) 55781 ENST00000283109.8 -30051 RIOK2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004672,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0007049,GO:0030071,GO:0030490,GO:0030490,GO:0030688,GO:0030688,GO:0042274,GO:0046777,GO:0046872,GO:0106310,GO:0106311,GO:2000208,GO:2000234 hsa03008 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 109204348 109205341 101 * Distal Intergenic 2241 ENST00000513777.1 26831 FER esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000226,GO:0000785,GO:0001932,GO:0004713,GO:0004713,GO:0004715,GO:0004715,GO:0005102,GO:0005154,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005938,GO:0006468,GO:0006935,GO:0007155,GO:0007169,GO:0007260,GO:0008157,GO:0008283,GO:0008284,GO:0008284,GO:0008289,GO:0010591,GO:0010762,GO:0015629,GO:0015630,GO:0018108,GO:0019221,GO:0030027,GO:0030054,GO:0030154,GO:0030335,GO:0030838,GO:0031234,GO:0031234,GO:0031532,GO:0032496,GO:0032869,GO:0033007,GO:0034446,GO:0034614,GO:0035426,GO:0035556,GO:0036006,GO:0036119,GO:0038028,GO:0038095,GO:0038095,GO:0038109,GO:0042058,GO:0043304,GO:0044331,GO:0045087,GO:0046777,GO:0048008,GO:0048008,GO:0050904,GO:0051092,GO:0070102 hsa04520 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 110615533 110616325 114 * Intron (ENST00000508571.6/642987, intron 2 of 5) 642987 ENST00000508571.6 9272 TMEM232 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 110811969 110813130 192 * Distal Intergenic 91137 ENST00000509432.1 56849 SLC25A46 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005739,GO:0005741,GO:0016021,GO:0090149 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 124171184 124171627 101 * Intron (ENST00000628324.2/103724389, intron 2 of 3) 101927397 ENST00000662643.1 143052 LOC101927397 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 137381013 137382278 94 * Intron (ENST00000394945.6/6695, intron 2 of 10) 6695 ENST00000509293.1 -15552 SPOCK1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001558,GO:0001764,GO:0004867,GO:0004869,GO:0005509,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005737,GO:0007155,GO:0007399,GO:0008191,GO:0010812,GO:0010951,GO:0010977,GO:0014069,GO:0016528,GO:0021953,GO:0022008,GO:0031594,GO:0033268 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 140854774 140855392 97 * Promoter (<=1kb) 56139 ENST00000562220.2 -491 PCDHA10 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005576,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007399 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141192898 141193957 114 * Promoter (1-2kb) 56126 ENST00000239446.6 545 PCDHB10 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007268,GO:0007416,GO:0016021,GO:0016339,GO:0045202 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141195865 141196903 230 * Intron (ENST00000624192.1/ENST00000624192.1, intron 1 of 1) 56125 ENST00000354757.5 -2724 PCDHB11 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007268,GO:0007399,GO:0007416,GO:0016021,GO:0016339,GO:0045202 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141233257 141243860 123 * Promoter (1-2kb) 84054 ENST00000570871.2 0 PCDHB19P esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141243986 141283166 129 * Intron (ENST00000686518.1/105378199, intron 1 of 1) 56121 ENST00000231173.6 0 PCDHB15 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0007399,GO:0032391 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141354447 141368324 94 * Promoter (<=1kb) 56103 ENST00000622527.1 0 PCDHGB2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141354447 141368324 124 * Promoter (1-2kb) 56103 ENST00000622527.1 0 PCDHGB2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141380950 141387951 98 * Promoter (<=1kb) 8641 ENST00000615384.1 0 PCDHGB4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0016020,GO:0016339 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141398511 141402094 112 * Promoter (1-2kb) 56101 ENST00000621169.1 524 PCDHGB5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003674,GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156,GO:0008150,GO:0070062 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 141412781 141442902 97 * Promoter (2-3kb) 56099 ENST00000612073.1 0 PCDHGB7 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005509,GO:0005887,GO:0007155,GO:0007156 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 146728353 146729778 96 * Intron (ENST00000394411.9/5521, intron 2 of 9) 5521 ENST00000512984.1 -127977 PPP2R2B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000159,GO:0005515,GO:0005739,GO:0005741,GO:0005829,GO:0005856,GO:0006915,GO:0019888,GO:0043666,GO:0070262 hsa03015,hsa04071,hsa04151,hsa04152,hsa04261,hsa04390,hsa04530,hsa04728,hsa05142,hsa05160,hsa05165 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 150891403 150904587 171 * Promoter (1-2kb) 91975 ENST00000427179.5 202 ZNF300 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006357,GO:0016604,GO:0043565,GO:0045944,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 150906703 150907793 103 * Promoter (1-2kb) 91975 ENST00000446148.6 -1720 ZNF300 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006357,GO:0016604,GO:0043565,GO:0045944,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 150921893 150923294 111 * Distal Intergenic 91975 ENST00000446148.6 -16910 ZNF300 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0001228,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006357,GO:0016604,GO:0043565,GO:0045944,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 171765923 171766572 107 * Distal Intergenic 644994 ENST00000524175.1 -7080 SMIM23 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 179099160 179099613 132 * Distal Intergenic 9509 ENST00000522937.1 22241 ADAMTS2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004222,GO:0005576,GO:0007283,GO:0008237,GO:0008270,GO:0016485,GO:0030198,GO:0030199,GO:0030324,GO:0030574,GO:0031012,GO:0043588,GO:0062023 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr5 179178606 179179099 94 * Intron (ENST00000251582.12/9509, intron 5 of 21) 9509 ENST00000523450.1 -55767 ADAMTS2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004222,GO:0005576,GO:0007283,GO:0008237,GO:0008270,GO:0016485,GO:0030198,GO:0030199,GO:0030324,GO:0030574,GO:0031012,GO:0043588,GO:0062023 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 1351027 1352485 94 * Distal Intergenic 106144586 ENST00000627866.1 -27005 LINC01394 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 2337362 2341033 120 * Intron (ENST00000657072.1/100508120, intron 2 of 4) 100508120 ENST00000534160.1 31069 GMDS-DT esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 2483606 2484610 99 * Exon (ENST00000659643.1/100508120, exon 5 of 5) 100508120 ENST00000666817.1 87034 GMDS-DT esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 26215877 26216626 119 * Promoter (<=1kb) 8339 ENST00000541790.4 62 H2BC8 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000786,GO:0002227,GO:0003677,GO:0003677,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005829,GO:0006334,GO:0006334,GO:0016567,GO:0019731,GO:0042802,GO:0046982,GO:0050830,GO:0061844,GO:0070062 hsa04613,hsa05034,hsa05203,hsa05322 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 27282827 27284171 356 * Distal Intergenic 94026 ENST00000444565.2 28102 POM121L2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005643,GO:0006405,GO:0006606,GO:0008139,GO:0017056 hsa03013,hsa05014 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 27290804 27291907 282 * Intron (ENST00000429945.1/ENST00000429945.1, intron 1 of 1) 94026 ENST00000444565.2 20366 POM121L2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005643,GO:0006405,GO:0006606,GO:0008139,GO:0017056 hsa03013,hsa05014 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 27680473 27681365 264 * Distal Intergenic 100507173 ENST00000685096.2 -12661 LINC01012 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28707570 28709408 330 * Distal Intergenic 387055 ENST00000456103.1 -58504 LINC00533 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28733428 28734728 107 * Distal Intergenic 387055 ENST00000456103.1 -84362 LINC00533 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28733428 28734869 328 * Distal Intergenic 387055 ENST00000456103.1 -84362 LINC00533 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28736821 28738254 180 * Distal Intergenic 387055 ENST00000456103.1 -87755 LINC00533 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28736821 28738437 396 * Distal Intergenic 387055 ENST00000456103.1 -87755 LINC00533 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28763764 28765118 273 * Distal Intergenic 401242 ENST00000440244.1 98232 LINC01623 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28763764 28765118 151 * Distal Intergenic 401242 ENST00000440244.1 98232 LINC01623 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 28793223 28793861 467 * Distal Intergenic 401242 ENST00000440244.1 69489 LINC01623 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 30408399 30410298 182 * Distal Intergenic 79897 ENST00000436442.2 63230 RPP21 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001682,GO:0001682,GO:0004526,GO:0004526,GO:0005654,GO:0005655,GO:0008033,GO:0030681,GO:0033204,GO:0042493,GO:0046872,GO:0090502 hsa03013 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 40684272 40686096 158 * Distal Intergenic 101929535 ENST00000438818.1 29267 LOC101929535 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 41361123 41362610 96 * Distal Intergenic 9436 ENST00000373086.3 25272 NCR2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004888,GO:0005515,GO:0005886,GO:0005887,GO:0006968,GO:0007165,GO:0009986,GO:0038023,GO:0045087,GO:0050776 hsa04650 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 56997571 57000151 95 * Intron (ENST00000370746.8/221336, intron 3 of 6) 221336 ENST00000484701.1 -13658 BEND6 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003682,GO:0003714,GO:0003714,GO:0005634,GO:0007399,GO:0045666,GO:0045746,GO:0045892 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 57822873 57823404 259 * Distal Intergenic 101927268 ENST00000653431.1 60893 LOC101927268 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 71077235 71078308 165 * Distal Intergenic 135152 ENST00000230053.11 -120175 B3GAT2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0000139,GO:0005975,GO:0006486,GO:0015018,GO:0015018,GO:0016021,GO:0030203,GO:0046872,GO:0050650 hsa00515,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 76022851 76023311 106 * Intron (ENST00000369950.8/3617, intron 5 of 16) 3617 ENST00000369950.8 49351 IMPG1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001750,GO:0001917,GO:0005201,GO:0005540,GO:0007601,GO:0008201,GO:0031012,GO:0033165,GO:0035374 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 80936883 80938160 138 * Distal Intergenic 594 ENST00000443221.2 483684 BCKDHB esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003826,GO:0003863,GO:0005515,GO:0005730,GO:0005739,GO:0005739,GO:0005759,GO:0005947,GO:0005947,GO:0007584,GO:0009083,GO:0009083,GO:0009083 hsa00280,hsa00640,hsa01100 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 84765597 84766550 133 * Promoter (1-2kb) 9096 ENST00000369663.10 -999 TBX18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000976,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001708,GO:0001756,GO:0001756,GO:0003163,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0016331,GO:0042803,GO:0051145,GO:0060829,GO:0060930,GO:0060931,GO:0072189,GO:0090103,GO:0090571,GO:0098907,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 84765597 84766550 488 * Promoter (1-2kb) 9096 ENST00000369663.10 -999 TBX18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000976,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001708,GO:0001756,GO:0001756,GO:0003163,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0016331,GO:0042803,GO:0051145,GO:0060829,GO:0060930,GO:0060931,GO:0072189,GO:0090103,GO:0090571,GO:0098907,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 84772572 84773056 301 * Distal Intergenic 9096 ENST00000369663.10 -7974 TBX18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000976,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001227,GO:0001708,GO:0001756,GO:0001756,GO:0003163,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0016331,GO:0042803,GO:0051145,GO:0060829,GO:0060930,GO:0060931,GO:0072189,GO:0090103,GO:0090571,GO:0098907,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 85725656 85726484 94 * Distal Intergenic 387066 ENST00000670094.1 -46724 SNHG5 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 100456994 100458165 1172 * Intron (ENST00000369208.8/6492, intron 2 of 11) 6492 ENST00000262901.4 5512 SIM1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003677,GO:0003700,GO:0005515,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007399,GO:0030154,GO:0046982 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 108824820 108826030 219 * Intron (ENST00000655744.1/ENST00000655744.1, intron 1 of 1) 84071 ENST00000368972.7 -22386 ARMC2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0007288,GO:0007288,GO:0044782 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 117172644 117172960 94 * Distal Intergenic 105377964 ENST00000666126.1 91857 LOC105377964 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 121819603 121821395 94 * Distal Intergenic 105377979 ENST00000701253.1 -36418 LOC105377979 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 129778119 129779324 145 * Distal Intergenic 93663 ENST00000368149.3 -67942 ARHGAP18 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001726,GO:0005096,GO:0005096,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0005881,GO:0005886,GO:0007264,GO:0008360,GO:0016607,GO:0030833,GO:0030833,GO:0032956,GO:0043547,GO:0045296,GO:0051056,GO:0051056,GO:0051056,GO:2000145 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 132395699 132396076 151 * Intron (ENST00000367963.8/26002, intron 1 of 11) 26002 ENST00000367963.8 5399 MOXD1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004500,GO:0005507,GO:0005515,GO:0005615,GO:0005789,GO:0006589,GO:0016021,GO:0030667,GO:0042420,GO:0042421 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 134789906 134793049 197 * Distal Intergenic 101928277 ENST00000447557.1 -82557 LOC101928277 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 134789906 134793049 210 * Distal Intergenic 101928277 ENST00000447557.1 -82557 LOC101928277 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 134793134 134794158 114 * Distal Intergenic 101928277 ENST00000447557.1 -85785 LOC101928277 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 136872803 136875111 99 * Intron (ENST00000541292.6/5191, intron 9 of 10) 340146 ENST00000331858.5 -47190 SLC35D3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005461,GO:0005462,GO:0005463,GO:0005769,GO:0005783,GO:0005794,GO:0008643,GO:0015297,GO:0015787,GO:0015789,GO:0016021,GO:0070863,GO:0097009,GO:1990569 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 148010261 148011293 114 * Intron (ENST00000668177.1/ENST00000668177.1, intron 1 of 1) 23328 ENST00000367469.5 -261011 SASH1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000209,GO:0001965,GO:0005515,GO:0005737,GO:0008022,GO:0010595,GO:0010632,GO:0019901,GO:0031435,GO:0031435,GO:0031666,GO:0032991,GO:0043507,GO:0043507,GO:0045766,GO:0060090,GO:1900044,GO:1900745,GO:1901224,GO:1901224,GO:1902498 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 149987333 149989127 203 * Distal Intergenic 646024 ENST00000403651.2 16030 RAET1K esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 149987333 149989127 200 * Distal Intergenic 646024 ENST00000403651.2 16030 RAET1K esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 151560888 151563914 172 * Intron (ENST00000239374.8/80129, intron 5 of 10) 80129 ENST00000544131.1 24617 CCDC170 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000226,GO:0005515,GO:0005794,GO:0008017,GO:0036064 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr6 154039963 154040295 226 * Promoter (<=1kb) 4988 ENST00000337049.8 468 OPRM1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001965,GO:0001965,GO:0002438,GO:0004930,GO:0004930,GO:0004979,GO:0004979,GO:0005245,GO:0005515,GO:0005768,GO:0005783,GO:0005794,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0005925,GO:0007186,GO:0007187,GO:0007197,GO:0007200,GO:0007218,GO:0007600,GO:0008022,GO:0008285,GO:0009314,GO:0019221,GO:0019233,GO:0019233,GO:0019904,GO:0030424,GO:0030425,GO:0031005,GO:0031635,GO:0031681,GO:0032094,GO:0032100,GO:0032496,GO:0032590,GO:0032839,GO:0038003,GO:0038003,GO:0038047,GO:0038047,GO:0042060,GO:0042220,GO:0042277,GO:0042383,GO:0042755,GO:0042923,GO:0043005,GO:0043204,GO:0044849,GO:0045121,GO:0048149,GO:0050769,GO:0051930,GO:0060079,GO:0061358,GO:0070374,GO:0070588,GO:0070848,GO:0071315,GO:0080135,GO:0097444,GO:0099055,GO:0099056,GO:0106072,GO:2000310 hsa04080,hsa04915,hsa05032 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 1216378 1216999 118 * Distal Intergenic 340260 ENST00000316333.9 -15873 UNCX esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000981,GO:0001502,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007389,GO:0010468,GO:0021516,GO:0021889,GO:0035726,GO:0045595,GO:1990837,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 1401935 1402680 282 * Distal Intergenic 79778 ENST00000493998.1 34931 MICALL2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001725,GO:0005515,GO:0005829,GO:0005886,GO:0005911,GO:0005923,GO:0030041,GO:0031005,GO:0031175,GO:0031267,GO:0031532,GO:0032432,GO:0032456,GO:0034446,GO:0042805,GO:0043005,GO:0046872,GO:0051015,GO:0055037,GO:0070830,GO:1903955 hsa04530 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 3162571 3163417 133 * Intron (ENST00000404626.4/100129603, intron 2 of 3) 100129603 ENST00000403226.1 -4000 LOC100129603 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 3780768 3781928 94 * Intron (ENST00000404826.7/221935, intron 4 of 44) 221935 ENST00000426596.1 -168992 SDK1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0007156,GO:0007156,GO:0007416,GO:0007416,GO:0010842,GO:0010842,GO:0016021,GO:0042802,GO:0045202,GO:0045202,GO:0045216,GO:0048148,GO:0060998 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 4917303 4918810 152 * Intron (ENST00000406755.5/221938, intron 3 of 7) 55698 ENST00000399583.4 -33587 RADIL esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001755,GO:0005515,GO:0005874,GO:0005874,GO:0007165,GO:0007275,GO:0032991,GO:0034446,GO:0034446,GO:0051020 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 5057205 5069645 154 * Intron (ENST00000407184.5/100533952, intron 5 of 7) 57786 ENST00000476992.1 218 RBAK esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000977,GO:0000981,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006355,GO:0006357,GO:0008270,GO:0045892 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 17916814 17917411 102 * Intron (ENST00000428135.7/23161, intron 1 of 25) 23161 ENST00000498463.5 -16566 SNX13 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005769,GO:0006886,GO:0009968,GO:0031901,GO:0032266,GO:0035091,GO:0043547 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 25209437 25210229 119 * Distal Intergenic 64111 ENST00000222674.2 18257 NPVF esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005102,GO:0005515,GO:0005576,GO:0007218,GO:0007218,GO:0032277,GO:0032277 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 25612225 25612809 131 * Intron (ENST00000656871.1/646588, intron 3 of 3) 646588 ENST00000659793.1 7632 LOC646588 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 25861969 25862274 129 * Distal Intergenic 100506236 ENST00000666265.1 -30060 LOC100506236 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 35254078 35255068 383 * Promoter (<=1kb) 57057 ENST00000408931.4 0 TBX20 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001085,GO:0001102,GO:0001228,GO:0001569,GO:0001570,GO:0001706,GO:0001708,GO:0001764,GO:0001947,GO:0001947,GO:0003143,GO:0003148,GO:0003175,GO:0003180,GO:0003193,GO:0003203,GO:0003207,GO:0003215,GO:0003272,GO:0003279,GO:0003344,GO:0005634,GO:0005737,GO:0006357,GO:0006936,GO:0008015,GO:0008283,GO:0009953,GO:0010991,GO:0021524,GO:0035922,GO:0036306,GO:0045892,GO:0045944,GO:0048370,GO:0055008,GO:0060045,GO:0060413,GO:0060577,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 43289942 43291532 108 * Intron (ENST00000490954.2/23072, intron 1 of 1) 23072 ENST00000464944.1 40805 HECW1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000209,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0016567,GO:0043161,GO:0045732,GO:0048814,GO:0061630,GO:0061630,GO:0090090,GO:2000650 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 55626031 55627449 139 * Distal Intergenic 105375287 ENST00000449899.1 32254 LOC105375287 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 64513507 64522239 110 * Distal Intergenic 340252 ENST00000470847.1 21980 ZNF680 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 64513507 64522239 188 * Distal Intergenic 340252 ENST00000470847.1 21980 ZNF680 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0000981,GO:0005634,GO:0006355,GO:0006357,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 68607607 68609428 239 * Distal Intergenic 105375341 ENST00000669425.1 -287931 LOC105375341 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 73662884 73664016 144 * Distal Intergenic 155382 ENST00000324941.5 -3815 VPS37D esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000813,GO:0000813,GO:0000813,GO:0005515,GO:0006612,GO:0006623,GO:0010008,GO:0016197,GO:0016236,GO:0019058,GO:0031902,GO:0036258,GO:0039702,GO:0043162,GO:0043231,GO:0043657,GO:0070062,GO:0075733 hsa04144 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 82554356 82555499 94 * Distal Intergenic 781 ENST00000356860.8 -110579 CACNA2D1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005245,GO:0005245,GO:0005245,GO:0005245,GO:0005886,GO:0005891,GO:0005891,GO:0006816,GO:0016529,GO:0046872,GO:0051924,GO:0060307,GO:0060402,GO:0061337,GO:0061577,GO:0070062,GO:0086002,GO:0086007,GO:0086048,GO:0086057,GO:0086091,GO:0098703,GO:0098903,GO:1901843,GO:1902514,GO:1904646,GO:1990454,GO:1990454 hsa04010,hsa04260,hsa04261,hsa04921,hsa05410,hsa05412,hsa05414 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 99805753 99806161 191 * Distal Intergenic 1576 ENST00000652018.1 -21505 CYP3A4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0002933,GO:0004497,GO:0004497,GO:0005496,GO:0005506,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005789,GO:0006629,GO:0006706,GO:0006805,GO:0008202,GO:0008202,GO:0008202,GO:0008203,GO:0008209,GO:0008210,GO:0008395,GO:0008395,GO:0008401,GO:0009822,GO:0016021,GO:0016098,GO:0016491,GO:0017144,GO:0019825,GO:0019899,GO:0020037,GO:0030343,GO:0034875,GO:0036378,GO:0042359,GO:0042572,GO:0042572,GO:0042573,GO:0042737,GO:0042737,GO:0042738,GO:0042759,GO:0043231,GO:0046483,GO:0050591,GO:0050649,GO:0050649,GO:0070330,GO:0070576,GO:0070989,GO:0070989,GO:0101020,GO:0101020,GO:0101021,GO:0102320 hsa00140,hsa00591,hsa00830,hsa00980,hsa00982,hsa00983,hsa01100,hsa04976,hsa05204 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 100656014 100656658 94 * Promoter (<=1kb) 51412 ENST00000160382.10 0 ACTL6B esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003682,GO:0003713,GO:0005200,GO:0005634,GO:0006325,GO:0006338,GO:0006357,GO:0006357,GO:0007010,GO:0007399,GO:0016358,GO:0016514,GO:0016514,GO:0016514,GO:0021510,GO:0035267,GO:0042551,GO:0043044,GO:0043967,GO:0045893,GO:0071565 hsa04714,hsa05225 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 101300114 101303244 94 * Promoter (2-3kb) 101927721 ENST00000429254.3 556 LNCPRESS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 101300114 101303244 114 * Promoter (2-3kb) 101927721 ENST00000429254.3 556 LNCPRESS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 101300114 101303560 1076 * Promoter (2-3kb) 101927721 ENST00000429254.3 556 LNCPRESS1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 101571935 101573460 109 * Distal Intergenic 100506527 ENST00000437900.1 -2929 LINC01007 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 101574227 101574650 94 * Distal Intergenic 100506527 ENST00000437900.1 -5221 LINC01007 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 101846609 101847928 101 * Intron (ENST00000437600.9/1523, intron 1 of 22) 1523 ENST00000558469.5 27688 CUX1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0000139,GO:0000301,GO:0000785,GO:0000977,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0005634,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005794,GO:0005829,GO:0006357,GO:0007275,GO:0030674,GO:0043565,GO:0050775,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 128194045 128196008 99 * Distal Intergenic 406917 ENST00000384972.2 -11864 MIR129-1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0032717,GO:0035195,GO:0035195,GO:0043537,GO:1900016,GO:1903231,GO:1905563 hsa05206 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 130731469 130735092 379 * Promoter (1-2kb) 136259 ENST00000583337.4 0 KLF14 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003682,GO:0005634,GO:0006357,GO:0043565,GO:0045944,GO:0045944,GO:0046872,GO:1902070,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 130731469 130735092 130 * Promoter (1-2kb) 136259 ENST00000583337.4 0 KLF14 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003682,GO:0005634,GO:0006357,GO:0043565,GO:0045944,GO:0045944,GO:0046872,GO:1902070,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 130731469 130735092 402 * Promoter (1-2kb) 136259 ENST00000583337.4 0 KLF14 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003682,GO:0005634,GO:0006357,GO:0043565,GO:0045944,GO:0045944,GO:0046872,GO:1902070,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 130731469 130735092 172 * Promoter (<=1kb) 136259 ENST00000583337.4 0 KLF14 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003682,GO:0005634,GO:0006357,GO:0043565,GO:0045944,GO:0045944,GO:0046872,GO:1902070,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 134269455 134270522 94 * Distal Intergenic 84912 ENST00000466599.1 24655 SLC35B4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000139,GO:0005462,GO:0005462,GO:0005462,GO:0005464,GO:0005464,GO:0005464,GO:0005515,GO:0005783,GO:0005794,GO:0006111,GO:0008643,GO:0015790,GO:0022857,GO:0030173,GO:0030176,GO:1990569 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 155196359 155197413 98 * Exon (ENST00000431083.1/ENST00000431083.1, exon 3 of 3) 105375586 ENST00000701183.1 -6258 LOC105375586 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 155475504 155476193 94 * Intron (ENST00000406197.5/285888, intron 4 of 4) 2020 ENST00000297375.4 17375 EN2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000978,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001650,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005730,GO:0006357,GO:0007275,GO:0016020,GO:0030182,GO:0030901,GO:0030902,GO:0043524,GO:0045944,GO:0048666,GO:1990403,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr7 157532394 157533005 105 * Distal Intergenic 105375610 ENST00000648425.1 16601 LOC105375610 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 3822798 3823325 153 * Intron (ENST00000635120.2/64478, intron 5 of 69) 64478 ENST00000518151.1 -114302 CSMD1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0016021 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 9837117 9838572 139 * Distal Intergenic 157627 ENST00000518557.5 62628 MIR124-1HG esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 11998143 11998943 136 * Promoter (2-3kb) 613211 ENST00000526438.6 1809 DEFB134 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005576,GO:0042742,GO:0045087 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 24913356 24914972 248 * Promoter (<=1kb) 4741 ENST00000523467.1 0 NEFM esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005200,GO:0005515,GO:0005883,GO:0008017,GO:0030424,GO:0033693,GO:0045111,GO:0097418 hsa05014,hsa05022 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 24913356 24914972 717 * Promoter (<=1kb) 4741 ENST00000433454.3 0 NEFM esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005200,GO:0005515,GO:0005883,GO:0008017,GO:0030424,GO:0033693,GO:0045111,GO:0097418 hsa05014,hsa05022 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 29505715 29507521 94 * Distal Intergenic 105379351 ENST00000522028.1 -40650 LOC105379351 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 30194701 30195530 153 * Exon (ENST00000649628.1/ENST00000649628.1, exon 1 of 3) 10671 ENST00000519830.1 38326 DCTN6 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000777,GO:0005813,GO:0005829,GO:0005869,GO:0006888,GO:0007052,GO:0019886,GO:0070840 hsa04962,hsa05014,hsa05016,hsa05022,hsa05132 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 35961092 35962680 111 * Intron (ENST00000523748.2/ENST00000523748.2, intron 4 of 5) 112268026 ENST00000662333.1 -7921 LOC112268026 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 43870157 43870789 108 * Distal Intergenic 340441 ENST00000519951.2 577674 POTEA esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 47152465 47153514 118 * Intron (ENST00000509729.3/105375817, intron 1 of 9) 100287846 ENST00000521874.1 -35791 LOC100287846 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 48484152 48485529 189 * Distal Intergenic 105375822 ENST00000521359.2 32513 LOC105375822 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 63045334 63047722 94 * Distal Intergenic 8836 ENST00000679326.1 -5927 GGH esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005576,GO:0005615,GO:0005634,GO:0005773,GO:0005829,GO:0006508,GO:0008238,GO:0008242,GO:0010043,GO:0032868,GO:0034722,GO:0034722,GO:0035578,GO:0035580,GO:0042470,GO:0042493,GO:0043312,GO:0045471,GO:0046900,GO:0070062,GO:1904724 hsa00790,hsa01240,hsa01523 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 64379977 64380736 342 * Promoter (1-2kb) 406908 ENST00000685732.1 745 MIR124-2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0035195 hsa05206 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 84277754 84278984 168 * Intron (ENST00000522613.5/138046, intron 2 of 2) 138046 ENST00000522647.1 92813 RALYL esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003723,GO:0003723,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0042802 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 86279693 86281953 139 * Intron (ENST00000520624.1/157724, intron 2 of 3) 157724 ENST00000520624.1 39193 SLC7A13 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0003333,GO:0015179,GO:0015807,GO:0016021,GO:1902475 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 88694990 88696638 126 * Intron (ENST00000658283.1/105375630, intron 4 of 6) 105375631 ENST00000668057.1 116506 LOC105375631 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 90655649 90656274 107 * Intron (ENST00000667296.1/102724670, intron 3 of 4) 102724670 ENST00000668846.1 9229 LOC102724670 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 108518870 108520548 140 * Distal Intergenic 9694 ENST00000519450.2 45019 EMC2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005737,GO:0005783,GO:0005789,GO:0032977,GO:0042406,GO:0045050,GO:0071816,GO:0072546,GO:0072546 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 124945966 124948532 164 * Promoter (2-3kb) 157381 ENST00000504665.5 1787 LINC00964 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 125459978 125460420 185 * Distal Intergenic 105375746 ENST00000521991.2 -26260 LOC105375746 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 127131935 127132277 99 * Intron (ENST00000645463.1/105375751, intron 6 of 6) 105375752 ENST00000641919.1 12140 LOC105375752 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 142266154 142267499 213 * Intron (ENST00000524325.6/203062, intron 12 of 13) 203062 ENST00000521825.1 12498 TSNARE1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000149,GO:0005484,GO:0006886,GO:0006906,GO:0012505,GO:0016021,GO:0031201,GO:0048278 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 144712985 144714739 1239 * Exon (ENST00000583427.1/ENST00000583427.1, exon 1 of 1) 100996662 ENST00000529026.1 7355 LOC100996662 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr8 144982238 144985089 94 * Intron (ENST00000426361.7/286101, intron 2 of 2) 286102 ENST00000534816.1 -9797 TMED10P1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 24367556 24368295 100 * Distal Intergenic 100129669 ENST00000604921.5 177381 IZUMO3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0016021,GO:0042803 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 26732781 26733404 97 * Distal Intergenic 79886 ENST00000517946.1 154074 CAAP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0006915,GO:2001268,GO:2001268 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 34818092 34819393 161 * Intron (ENST00000658462.1/23349, intron 1 of 2) 23349 ENST00000658462.1 8072 PHF24 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0007214,GO:0008277,GO:0032228,GO:0046872,GO:0050966 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 35973994 35976374 94 * Intron (ENST00000647905.1/ENST00000647905.1, intron 2 of 2) 56656 ENST00000341959.2 -15840 OR2S2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0007608,GO:0016021,GO:0050911 hsa04740 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 36005698 36006991 127 * Intron (ENST00000647905.1/ENST00000647905.1, intron 2 of 2) 8434 ENST00000377966.4 -29922 RECK esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001955,GO:0002040,GO:0004866,GO:0004866,GO:0004867,GO:0005515,GO:0005576,GO:0005886,GO:0005886,GO:0005886,GO:0007566,GO:0008191,GO:0016020,GO:0017147,GO:0030198,GO:0030336,GO:0031225,GO:0035115,GO:0045765,GO:0060070,GO:0090210,GO:0090263,GO:1904684,GO:1904684,GO:1904684,GO:1904928,GO:1990909 hsa05206 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 40879360 40900286 117 * Distal Intergenic 100302167 ENST00000622265.1 28806 MIR1299 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 78394804 78395765 173 * Distal Intergenic 29968 ENST00000347159.6 97661 PSAT1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004648,GO:0004648,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006564,GO:0006564,GO:0006564,GO:0008615,GO:0030170,GO:0042802,GO:0070062 hsa00260,hsa00270,hsa00750,hsa01100,hsa01200,hsa01230,hsa01240 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 78518155 78519063 225 * Distal Intergenic 29968 ENST00000347159.6 221012 PSAT1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004648,GO:0004648,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006564,GO:0006564,GO:0006564,GO:0008615,GO:0030170,GO:0042802,GO:0070062 hsa00260,hsa00270,hsa00750,hsa01100,hsa01200,hsa01230,hsa01240 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 91554865 91555392 131 * Distal Intergenic 100500821 ENST00000580936.1 -80859 MIR3910-1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 91951800 91952705 107 * Promoter (1-2kb) 4920 ENST00000375708.4 -1572 ROR2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0001502,GO:0001756,GO:0004714,GO:0005109,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005874,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007165,GO:0007169,GO:0007223,GO:0007224,GO:0007254,GO:0007275,GO:0008285,GO:0009986,GO:0010976,GO:0014002,GO:0014068,GO:0017147,GO:0017147,GO:0018108,GO:0030282,GO:0030335,GO:0030425,GO:0030509,GO:0030538,GO:0030539,GO:0030669,GO:0031435,GO:0033674,GO:0042472,GO:0042733,GO:0043025,GO:0043235,GO:0043410,GO:0043507,GO:0045165,GO:0045651,GO:0045893,GO:0046872,GO:0051968,GO:0060071,GO:0060395,GO:0070374,GO:0090090,GO:0090263,GO:1900020,GO:1904929,GO:1905517 hsa04310 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 93949361 93950570 1190 * Promoter (2-3kb) 56033 ENST00000401724.1 2861 BARX1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000977,GO:0000981,GO:0000981,GO:0003700,GO:0005634,GO:0006357,GO:0007267,GO:0009952,GO:0030178,GO:0030855,GO:0048536,GO:0055123 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 96837603 96838468 188 * Intron (ENST00000481138.6/158431, intron 4 of 5) 158431 ENST00000535338.5 14604 ZNF782 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000978,GO:0001228,GO:0005634,GO:0006357,GO:0045944,GO:0046872 hsa05168 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 98365028 98366709 104 * Intron (ENST00000259455.4/9568, intron 12 of 18) 9568 ENST00000634457.1 4862 GABBR2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004888,GO:0004965,GO:0005515,GO:0005737,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007186,GO:0007194,GO:0007214,GO:0007214,GO:0007268,GO:0038039,GO:0038039,GO:0043005,GO:0045211,GO:0046982,GO:0150099,GO:1902710 hsa04024,hsa04080,hsa04727,hsa04742,hsa04915,hsa04929,hsa05032 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 112648258 112649735 168 * Intron (ENST00000337530.11/158405, intron 3 of 3) 58493 ENST00000481146.6 68351 INIP esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0005654,GO:0006281,GO:0006281,GO:0006974,GO:0010212,GO:0035861,GO:0070876,GO:0070876 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 122730926 122732371 102 * Distal Intergenic 254973 ENST00000259466.1 6936 OR1L4 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004930,GO:0004984,GO:0005886,GO:0007186,GO:0016021,GO:0050911 hsa04740 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 126221298 126222367 128 * Distal Intergenic 101929116 ENST00000419853.1 53551 LOC101929116 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 133501194 133503411 109 * Distal Intergenic 389827 ENST00000339996.4 21548 MYMK esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005886,GO:0005886,GO:0005887,GO:0007517,GO:0007520,GO:0007520,GO:0014905,GO:0030173,GO:0045026,GO:1904206 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 134999740 135002570 112 * Distal Intergenic 105376314 ENST00000417054.2 62807 LOC105376314 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 135627261 135629389 95 * Intron (ENST00000371763.6/360203, intron 3 of 4) 360203 ENST00000371763.6 10151 GLT6D1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0005794,GO:0005975,GO:0016021,GO:0016757,GO:0016758,GO:0030259,GO:0031982 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chr9 137294413 137295143 144 * Exon (ENST00000566954.1/ENST00000566954.1, exon 1 of 1) 441478 ENST00000356628.4 7128 NRARP esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000122,GO:0001569,GO:0001938,GO:0002043,GO:0005515,GO:0007219,GO:0032525,GO:0045581,GO:0045746,GO:0045746,GO:0090263,GO:0090263,GO:1902367 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chrX 888155 891571 130 * Distal Intergenic 6473 ENST00000381575.6 257348 SHOX esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000785,GO:0000981,GO:0000981,GO:0001228,GO:0001228,GO:0001501,GO:0005515,GO:0005634,GO:0005654,GO:0006357,GO:0043231,GO:0043565,GO:0043565,GO:0045944,GO:1990837,GO:1990837 NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chrX 20542237 20542859 113 * Distal Intergenic 6197 ENST00000643402.1 -274718 RPS6KA3 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0000287,GO:0001501,GO:0002224,GO:0004672,GO:0004674,GO:0004711,GO:0005515,GO:0005524,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005654,GO:0005730,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005829,GO:0006915,GO:0007049,GO:0007165,GO:0007417,GO:0018105,GO:0018105,GO:0019901,GO:0030307,GO:0032496,GO:0035556,GO:0043027,GO:0043066,GO:0043154,GO:0043555,GO:0043620,GO:0045597,GO:0045944,GO:0106310,GO:0106311 hsa04010,hsa04114,hsa04150,hsa04714,hsa04720,hsa04722,hsa04914,hsa04931,hsa05135 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chrX 45368581 45369424 94 * Distal Intergenic 105373191 ENST00000450246.1 48123 LOC105373191 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chrX 56846248 56847135 94 * Intron (ENST00000640101.1/169981, intron 7 of 7) 442454 ENST00000421129.1 -108671 UQCRBP1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chrX 75739878 75741795 112 * Exon (ENST00000399586.2/286495, exon 1 of 1) 286495 ENST00000399586.2 5116 TTC3P1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chrX 115928260 115928933 94 * Intron (ENST00000664453.1/642776, intron 1 of 3) 642776 ENST00000664453.1 40089 DANT2 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA NA NA NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA chrX 150690338 150690934 125 * Promoter (2-3kb) 8776 ENST00000493995.6 -2037 MTMR1 esophagus squamous epithelium h3k27me3&h3k9me3 NA GO:0004438,GO:0004438,GO:0004438,GO:0004725,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005737,GO:0005829,GO:0005886,GO:0006661,GO:0016020,GO:0035335,GO:0042803,GO:0046856,GO:0046856,GO:0052629,GO:0052629,GO:0060304 hsa00562,hsa01100,hsa04070 NA GSE188900;GSE196756 35418165;NA